RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356489.9

BCKDHB-202, Transcript of branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BCKDHB, Length 1,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHB-202ENST00000356489 CDK5R2Q13319 367 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 SHFQ7M4L6 423 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 AMELYQ99218 206 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 YIPF3Q9GZM5 350 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 C1orf198Q9H425 327 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 AMBNQ9NP70 447 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 LOC100509620A0A075B734 347 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 SNTNA6NMZ2 147 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 ABCD4O14678 606 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 APOL3O95236 402 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 GOSR1O95249 250 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 STOMP27105 288 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 CALCRP30988 508 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 POU4F2Q12837 409 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 ELFN2Q5R3F8 820 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 TMEM154Q6P9G4 183 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 SLC30A7Q8NEW0 376 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 RNFT2Q96EX2 444 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 TMEM204Q9BSN7 226 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 ABHD6Q9BV23 337 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 HDHD2Q9H0R4 259 aa20.48■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 TACC2O95359 2948 aa20.47■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa20.47■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 PTHP01270 115 aa20.47■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 COX5BP10606 129 aa20.47■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 CCL2P13500 99 aa20.47■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 ZNF35P13682 527 aa20.47■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 RFLNBQ8N5W9 214 aa20.47■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 ZNF454Q8N9F8 522 aa20.47■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 OR4F15Q8NGB8 312 aa20.47■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 OR1F12Q8NHA8 337 aa20.47■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 POM121L2Q96KW2 1035 aa20.47■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 ATPIF1Q9UII2 106 aa20.47■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 COPS3Q9UNS2 423 aa20.47■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 CTAG2O75638 210 aa20.46■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 ALOX5APP20292 161 aa20.46■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 HTR5AP47898 357 aa20.46■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 ZNF787Q6DD87 383 aa20.46■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 SLC35F2Q8IXU6 374 aa20.46■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 SLC7A6Q92536 515 aa20.46■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 SLAMF6Q96DU3 332 aa20.46■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 ATF6BQ99941 703 aa20.46■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 UNC79Q9P2D8 2635 aa20.45■□□□□ 0.87
BCKDHB-202ENST00000356489 A0A1W2PPR1 153 aa20.45■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 J3QRE1 110 aa20.45■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 CD3EP07766 207 aa20.45■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 LYNP07948 512 aa20.45■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 APLNRP35414 380 aa20.45■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 TBC1D28Q2M2D7 210 aa20.45■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa20.45■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 ADAM5Q6NVV9 412 aa20.45■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 IL17RDQ8NFM7 739 aa20.45■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 RNF133Q8WVZ7 376 aa20.45■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 LGALS12Q96DT0 336 aa20.45■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 C14orf79Q96F83 325 aa20.45■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 COQ7Q99807 217 aa20.45■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 LAMP5Q9UJQ1 280 aa20.45■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 RNF115Q9Y4L5 304 aa20.45■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 SHISA9B4DS77 424 aa20.44■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa20.44■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 PLAUP00749 431 aa20.44■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 CRYAAP02489 173 aa20.44■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 SLC15A1P46059 708 aa20.44■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 KBTBD8Q8NFY9 601 aa20.44■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 MARVELD3Q96A59 401 aa20.44■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 AKAP6Q13023 2319 aa20.43■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 C5orf49A4QMS7 147 aa20.43■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 PRR32B1ATL7 298 aa20.43■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 DBHP09172 617 aa20.43■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 ATP6V1E1P36543 226 aa20.43■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 GDI2P50395 445 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 RHOUQ7L0Q8 258 aa20.43■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 THEM6Q8WUY1 208 aa20.43■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 CNBD2Q96M20 576 aa20.43■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 MNTQ99583 582 aa20.43■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 RHNO1Q9BSD3 238 aa20.43■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa20.43■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa20.43■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 ABCA12Q86UK0 2595 aa20.43■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 ZNF878C9JN71 531 aa20.43■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 DENRO43583 198 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 OR2T7P0C7T2 308 aa20.43■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 HGFACQ04756 655 aa20.43■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 RAB40BQ12829 278 aa20.43■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 ECH1Q13011 328 aa20.43■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 SLC22A25Q6T423 547 aa20.43■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 SPATC1Q76KD6 591 aa20.43■□□□□ 0.86
BCKDHB-202ENST00000356489 OR1J2Q8NGS2 313 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms