RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 SIT1Q9Y3P8 196 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 MEIS3P2A8K0S8 358 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 HEXAP06865 529 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CHRM4P08173 479 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 DBHP09172 617 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CT45A10P0DMU9 189 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 DPP4P27487 766 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 SDHAP31040 664 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 DEFB103AP81534 67 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 MS4A2Q01362 244 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 BTN1A1Q13410 526 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 FAM58AQ8N1B3 248 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 LAT2Q9GZY6 243 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 DSPPQ9NZW4 1301 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 PTPRFP10586 1907 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 IFNL4K9M1U5 179 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 SIX6O95475 246 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 OR8U8P0C7N1 319 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 PRR35P0CG20 571 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF28P17035 718 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 RAB7AP51149 207 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 NSDHLQ15738 373 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ADIRFQ15847 76 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 DUSP5Q16690 384 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 C11orf87Q6NUJ2 197 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 BAGE3Q86Y29 109 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 BAGE2Q86Y30 109 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 APH1AQ96BI3 265 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ABHD1Q96SE0 405 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 STARD5Q9NSY2 213 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ANTXRLA6NF34 631 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 IFITM5A6NNB3 132 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 DHRS7CA6NNS2 312 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ALG1L2C9J202 215 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 DVL2O14641 736 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 FUT1P19526 365 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 C12orf54Q6X4T0 127 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF687Q8N1G0 1237 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 MORN4Q8NDC4 146 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 FGF13Q92913 245 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ARRDC3Q96B67 414 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 DIRC2Q96SL1 478 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 FIZ1Q96SL8 496 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 DEFB126Q9BYW3 111 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 FZD3Q9NPG1 666 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM167BQ9NRX6 74 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 MED16Q9Y2X0 877 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 HELZP42694 1942 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 H3BQ06 376 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 GABRB1P18505 474 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 NTF3P20783 257 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 PRRT3Q5FWE3 981 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 AFMIDQ63HM1 303 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ETV3LQ6ZN32 361 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 SLC35E3Q7Z769 313 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 NT5CQ8TCD5 201 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CPT1CQ8TCG5 803 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ST8SIA2Q92186 375 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 LRFN3Q9BTN0 628 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 Q9N2K0 584 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PP55 124 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 NKX6-3A6NJ46 265 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 SEMG1P04279 462 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CAPNS1P04632 268 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 HNF1AP20823 631 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 DIO1P49895 249 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 DAPP51397 102 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 SERF2P84101 59 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 IL24Q13007 206 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CDK5R1Q15078 307 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 THNSL2Q86YJ6 484 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 NAGSQ8N159 534 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 TEX29Q8N6K0 151 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 HRASLS2Q9NWW9 162 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 POU2F3Q9UKI9 436 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 NRXN2Q9P2S2 1712 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CLDN34H7C241 214 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CBR3O75828 277 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CLDN7O95471 211 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 KNG1P01042 644 aa4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms