RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 GPR148Q8TDV2 347 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 SMIM8Q96KF7 97 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 OCSTAMPQ9BR26 566 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 TMEM74BQ9NUR3 256 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 MFNGO00587 321 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 IL2RAP01589 272 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 DAOP14920 347 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 ADAM8P78325 824 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 DEFB134Q4QY38 66 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 ADAM5Q6NVV9 412 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 ZNF595Q8IYB9 648 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 MFSD9Q8NBP5 474 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 OR2G2Q8NGZ5 317 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 RNF126Q9BV68 326 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 COMMD4Q9H0A8 199 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 KLK13Q9UKR3 277 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 RHPN2P1A8MT19 583 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 LDB3O75112 727 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 MED6O75586 246 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 AK1P00568 194 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 SERPINF1P36955 418 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 P2RY4P51582 365 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 AWAT1Q58HT5 328 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 LEG1Q6P5S2 330 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 ZAR1Q86SH2 424 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 SLC43A2Q8N370 569 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 PLPP7Q8NBV4 271 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 TOLLIPQ9H0E2 274 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 SYT4Q9H2B2 425 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 UFSP2Q9NUQ7 469 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 A0A1W2PPC1 479 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 A0A1W2PQF6 199 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 FAM157AC9JC47 383 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 H0YIZ8 118 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 SLC17A2O00624 439 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 MAOAP21397 527 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 RPS27P42677 84 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 GLP1RP43220 463 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 CDPF1Q6NVV7 123 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 KIRREL1Q96J84 757 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 RHOVQ96L33 236 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 IP6K3Q96PC2 410 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 SRMSQ9H3Y6 488 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 FANCMQ8IYD8 2048 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 C2orf74A8MZ97 194 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 OIP5O43482 229 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 SERPINA5P05154 406 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 NME1P15531 152 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 BTF3P20290 206 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 SKP2Q13309 424 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 SECTM1Q8WVN6 248 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 MCHR2Q969V1 340 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 MRGPRFQ96AM1 343 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 TVP23AA6NH52 213 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 MBTPS2O43462 519 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 LRP3O75074 770 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 FCGR3AP08637 254 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 AKR1C4P17516 323 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 CCKBRP32239 447 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 ID4P47928 161 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 PYY3Q5JQD4 70 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 FRMD1Q8N878 549 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 PATE1Q8WXA2 126 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 ROBO4Q8WZ75 1007 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 ZDHHC12Q96GR4 267 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 TAAR9Q96RI9 348 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 WIF1Q9Y5W5 379 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 VCANP13611 3396 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 C7orf77A4D0Y5 90 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 TMEM235A6NFC5 223 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 FBXO24O75426 580 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 SLC34A2O95436 690 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 SLC16A9Q7RTY1 509 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 SFTPA2Q8IWL1 248 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 BHLHE23Q8NDY6 225 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 ELSPBP1Q96BH3 223 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 C20orf24Q9BUV8 137 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 FN3KRPQ9HA64 309 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 SLC17A5Q9NRA2 495 aa15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 EML5Q05BV3 1969 aa15.11■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 FITM1A5D6W6 292 aa15.11■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms