RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 CD53P19397 219 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
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PACSIN3-201ENST00000298838 HIST1H3AP68431 136 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC3A1Q07837 685 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 SCRN3Q0VDG4 424 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 TAF13Q15543 124 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 HIST2H3AQ71DI3 136 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 BTLAQ7Z6A9 289 aa18.18■□□□□ 0.5
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PACSIN3-201ENST00000298838 SKA3Q8IX90 412 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 HSD17B8Q92506 261 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 TMED9Q9BVK6 235 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 IL18BPO95998 194 aa18.17■□□□□ 0.5
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PACSIN3-201ENST00000298838 STARD4Q96DR4 205 aa18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 PGLYRP3Q96LB9 341 aa18.17■□□□□ 0.5
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PACSIN3-201ENST00000298838 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
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PACSIN3-201ENST00000298838 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A096LPE4 126 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1W2PPZ6 126 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRTM2O43300 516 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 HLA-DPB1P04440 258 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 CD1AP06126 327 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 HSD11B1P28845 292 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 DCTDP32321 178 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
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PACSIN3-201ENST00000298838 NFATC3Q12968 1075 aa18.16■□□□□ 0.5
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PACSIN3-201ENST00000298838 SLC36A2Q495M3 483 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 FDX2Q6P4F2 183 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD16Q6P6B7 361 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 OR2G2Q8NGZ5 317 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 GHSRQ92847 366 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 ATF6BQ99941 703 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 NIPAL2Q9H841 368 aa18.16■□□□□ 0.5
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PACSIN3-201ENST00000298838 SLC5A6Q9Y289 635 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 SHANK1Q9Y566 2161 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC22A1O15245 554 aa18.16■□□□□ 0.5
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PACSIN3-201ENST00000298838 GRB2P62993 217 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 TRAM1Q15629 374 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 ST3GAL2Q16842 350 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 ELFN2Q5R3F8 820 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF544Q6NX49 715 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 OR1K1Q8NGR3 316 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 HDHD2Q9H0R4 259 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 SSR3Q9UNL2 185 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 R4GMQ9 66 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 SGCEO43556 437 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 GPRIN2O60269 458 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 GPX5O75715 221 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 CGAP01215 116 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 CD8BP10966 210 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 CTSSP25774 331 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 CASP6P55212 293 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 VBP1P61758 197 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 RAB35Q15286 201 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 CNPY1Q3B7I2 92 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 COQ7Q99807 217 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 FRRS1LQ9P0K9 344 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 DOK2O60496 412 aa18.14■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 IGHV1-2P23083 117 aa18.14■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 FABP5Q01469 135 aa18.14■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 PMPCAQ10713 525 aa18.14■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 MS4A15Q8N5U1 240 aa18.14■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 C4orf45Q96LM5 186 aa18.14■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa18.14■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 CENPOQ9BU64 300 aa18.14■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 OR2H1Q9GZK4 316 aa18.14■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa18.14■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 ZFPL1O95159 310 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 PATE4P0C8F1 98 aa18.14■□□□□ 0.49
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