RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 Q8NA96 180 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 PNPLA2Q96AD5 504 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 GAL3ST4Q96RP7 486 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 SEC22CQ9BRL7 303 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 KLK11Q9UBX7 282 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 MOKQ9UQ07 419 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 CD96P40200 585 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ARG2P78540 354 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 MPPED2Q15777 294 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFAF6Q330K2 333 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM220AQ7Z4H9 259 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ZADH2Q8N4Q0 377 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 C16orf52Q8NHV5 167 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 HAS2Q92819 552 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 MED11Q9P086 117 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 EML6Q6ZMW3 1958 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 MCIDASD6RGH6 385 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP3CBP16298 524 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL4P36578 427 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A1P53007 311 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 EBPQ15125 230 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF141Q15928 474 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 PXDC1Q5TGL8 231 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF227Q86WZ6 799 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ARMC10Q8N2F6 343 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52R1Q8NGF1 315 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 HES7Q9BYE0 225 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 COPS3Q9UNS2 423 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 CSF1P09603 554 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 NAGAP17050 411 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 TAS2R20P59543 309 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 GMFBP60983 142 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 C7orf57Q8NEG2 295 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 MNTQ99583 582 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 TTTY10Q9BZA0 68 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC6A5Q9Y345 797 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 HSPB2A8KAH6 182 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 GLSO94925 669 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFPL1O95159 310 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 APEHP13798 732 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 CDK2P24941 298 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMB10P40306 273 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFSF10P50591 281 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 HSPB2Q16082 182 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 NNATQ16517 81 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 STAC2Q6ZMT1 411 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZS92 163 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC16A9Q7RTY1 509 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 GLB1L2Q8IW92 636 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 RASL10BQ96S79 203 aa23.53■■□□□ 1.36
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CAPNS1-201ENST00000246533 ACOD1A6NK06 481 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 A8MXK9 166 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 DUX4L2P0CJ85 424 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 DUX4L3P0CJ86 424 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 DUX4L4P0CJ87 422 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 DUX4L5P0CJ88 424 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 DUX4L6P0CJ89 424 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 DUX4L7P0CJ90 424 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 CFPP27918 469 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 EMDP50402 254 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 CBFBQ13951 182 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 CA10Q9NS85 328 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 DUX4Q9UBX2 424 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 SVILO95425 2214 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 XRCC3O43542 346 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 SUSD5O60279 629 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 SELENOFO60613 162 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 RBBP9O75884 186 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 AQP8O94778 261 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 NMBP08949 121 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 OR8K3Q8NH51 312 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 ADIPOR1Q96A54 375 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5H15A6NDH6 313 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 H7C417 338 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 IMPA2O14732 288 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 NEURL1O76050 574 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 HRGP04196 525 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 OR51L1Q8NGJ5 315 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5AK2Q8NH90 309 aa23.51■■□□□ 1.35
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