RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641487.1

CASC19-233, Transcript of cancer susceptibility 19, human

Gene CASC19, Length 966 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC19-233	ENST00000641487	FAM159B	A6NKW6	160 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	SH3BGRL	O75368	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	SUPT3H	O75486	399 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	CBR3	O75828	277 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	AIFM1	O95831	613 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	CRH	P06850	196 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	SRD5A2	P31213	254 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	TNFSF8	P32971	234 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	MAGEA8	P43361	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	CLDN20	P56880	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	RAB11A	P62491	216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	NAB1	Q13506	487 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	SPHAR	Q15513	63 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	RAB11B	Q15907	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	EIPR1	Q53HC9	387 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	OR2A2	Q6IF42	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	SHF	Q7M4L6	423 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	CXorf58	Q96LI9	332 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	SERPINI1	Q99574	410 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	BDH2	Q9BUT1	245 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	AHSP	Q9NZD4	102 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	PRODH2	Q9UF12	536 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	ACOT9	Q9Y305	439 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CASC19-233	ENST00000641487	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487		A0A087X1B8	175 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487		E5RGE8	158 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	TPST2	O60704	377 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	ICOSLG	O75144	302 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	EED	O75530	441 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	LRAT	O95237	230 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	ATP1B1	P05026	303 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	GFAP	P14136	432 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	CPM	P14384	443 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	ZNF23	P17027	643 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	NT5E	P21589	574 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	PCMT1	P22061	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	GPX3	P22352	226 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	STX2	P32856	288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	SFTPD	P35247	375 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	MNDA	P41218	407 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	SLCO1A2	P46721	670 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	XK	P51811	444 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	FOXF2	Q12947	444 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	CALCOCO2	Q13137	446 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	BCL2A1	Q16548	175 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	SYPL1	Q16563	259 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	TMEM107	Q6UX40	140 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	TMEM64	Q6YI46	380 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	IFNE	Q86WN2	208 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	RNF128	Q8TEB7	428 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-233	ENST00000641487	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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