RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	C4BPB	P20851	252 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CD70	P32970	193 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	RGR	P47804	291 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	STX5	Q13190	355 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ART3	Q13508	389 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM215	Q68D42	235 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	UBE2E3	Q969T4	207 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SDSL	Q96GA7	329 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SLITRK2	Q9H156	845 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616		Q9HAA7	133 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	NDE1	Q9NXR1	346 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	DHRS7	Q9Y394	339 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	USP34	Q70CQ2	3546 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	UBD	O15205	165 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	GPI	P06744	558 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ANXA5	P08758	320 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CD1D	P15813	335 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	IL32	P24001	234 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	GIF	P27352	417 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	HOXA6	P31267	233 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	RRM2	P31350	389 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SAA4	P35542	130 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CSK	P41240	450 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNJ3	P48549	501 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	POU3F4	P49335	361 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TTPA	P49638	278 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	STC1	P52823	247 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ART1	P52961	327 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM50B	P56557	158 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP6V0D1	P61421	351 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	NAA20	P61599	178 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	MAPRE2	Q15555	327 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	UNC50	Q53HI1	259 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	UTS2B	Q765I0	119 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4C3	Q8NH37	302 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	NAT6	Q93015	286 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNA7	Q96RP8	456 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC29A1	Q99808	456 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	GABRG3	Q99928	467 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PPA2	Q9H2U2	334 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		4.18	□□□□□ -1.74

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