RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635691.1

EP300-211, Transcript of E1A binding protein p300, human

TSL 3

Gene EP300, Length 402 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EP300-211	ENST00000635691	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	TMEM17	Q86X19	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	XYLT1	Q86Y38	959 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	PTOV1	Q86YD1	416 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	EXD3	Q8N9H8	876 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	TMEM239	Q8WW34	195 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	APH1B	Q8WW43	257 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	GGH	Q92820	318 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	LHX4	Q969G2	390 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	MCHR2	Q969V1	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	UPRT	Q96BW1	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	SLC38A3	Q99624	504 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	MGLL	Q99685	303 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	OR51E2	Q9H255	320 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-211	ENST00000635691	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		4.59	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	ANK1	P16157	1881 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	ITPR1	Q14643	2758 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	FRG2C	A6NGY1	282 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691		A8MT66	165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691		E9PLN8	166 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	GNGT2	O14610	69 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	CHEK1	O14757	476 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	SLC31A2	O15432	143 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	PRKY	O43930	277 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	PRAF2	O60831	178 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	TNFSF15	O95150	251 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	AP2A1	O95782	977 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	HP	P00738	406 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	SERPINA1	P01009	418 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	TGFB1	P01137	390 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	RLN2	P04090	185 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	PRNP	P04156	253 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	SEMG1	P04279	462 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	IGHV4-34	P06331	123 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	PAX1	P15863	534 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	PPP3CB	P16298	524 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	GPD1	P21695	349 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	TACR1	P25103	407 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	OR1E1	P30953	314 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	CSK	P41240	450 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	EVX1	P49640	407 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	DAP	P51397	102 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	ATP5J2	P56134	94 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	MTCP1	P56278	107 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	CCL7	P80098	99 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	SLC3A1	Q07837	685 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	DOC2B	Q14184	412 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	OPCML	Q14982	345 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	FCN2	Q15485	313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	MSMP	Q1L6U9	139 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	ISX	Q2M1V0	245 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	LINC00303	Q3SY05	128 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-211	ENST00000635691	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms