RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 TMPPEQ6ZT21 453 aa21.07■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 Q6ZT83 130 aa21.07■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 PXKQ7Z7A4 578 aa21.07■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4K13Q8NH42 304 aa21.07■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF417Q8TAU3 575 aa21.07■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa21.07■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP21.07■□□□□ 0.961e-6■■■□□ 15.5
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CAPNS1-216ENST00000628306 MS4A18H0YCH9 400 aa21.06■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 AHCYL1O43865 530 aa21.06■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 CENPAP49450 140 aa21.06■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL27P61353 136 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 MS4A18Q3C1V0 323 aa21.06■□□□□ 0.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 Q96M85 177 aa21.06■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC182A6NF36 153 aa21.05■□□□□ 0.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 DIO1P49895 249 aa21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35A1P78382 337 aa21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 GGTLC2Q14390 218 aa21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 OR7A5Q15622 319 aa21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM249Q2WGJ8 235 aa21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 LCN1P1Q5VSP4 162 aa21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 JAZF1Q86VZ6 243 aa21.05■□□□□ 0.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PRG6 482 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 A6NIZ1 184 aa21.04■□□□□ 0.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV1-2P23083 117 aa21.04■□□□□ 0.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 RAP1AP62834 184 aa21.04■□□□□ 0.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa21.04■□□□□ 0.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 NMNAT3Q96T66 252 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 OR6C68A6NDL8 312 aa21.03■□□□□ 0.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 SPHARQ15513 63 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 SDR9C7Q8NEX9 313 aa21.03■□□□□ 0.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 NOX1Q9Y5S8 564 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PNR3 127 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 E7EQL1 145 aa21.02■□□□□ 0.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 RENP00797 406 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP6V1E1P36543 226 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 DAP3P51398 398 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 H3F3AP84243 136 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 C1DQ13901 141 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 PAQR6Q6TCH4 344 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 ACBD7Q8N6N7 88 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 CYB561A3Q8NBI2 242 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa21.02■□□□□ 0.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 OTULINQ96BN8 352 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 RASD2Q96D21 266 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5B2Q96R09 309 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 CACNG6Q9BXT2 260 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 OR51V1Q9H2C8 321 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 MED20Q9H944 212 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM160Q9NX00 188 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 XKRYO14609 159 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 CYTIPO60759 359 aa21.01■□□□□ 0.95
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