RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa24.77■■□□□ 1.56
SEMA3B-215ENST00000621029 GLB1L2Q8IW92 636 aa24.77■■□□□ 1.56
SEMA3B-215ENST00000621029 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SEMA3B-215ENST00000621029 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SEMA3B-215ENST00000621029 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SEMA3B-215ENST00000621029 FUZQ9BT04 418 aa24.77■■□□□ 1.56
SEMA3B-215ENST00000621029 WACQ9BTA9 647 aa24.77■■□□□ 1.56
SEMA3B-215ENST00000621029 B2RBV5 119 aa24.76■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 IMPA2O14732 288 aa24.76■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 SGCEO43556 437 aa24.76■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF81P51508 661 aa24.76■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM33P57088 247 aa24.76■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 FXYD6P3P58550 94 aa24.76■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM120AOSQ5T036 256 aa24.76■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 C1orf174Q8IYL3 243 aa24.76■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 LINC01356Q8N9X3 169 aa24.76■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 NUAK2Q9H093 628 aa24.76■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 POLR1DQ9Y2S0 133 aa24.76■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 MPZL1O95297 269 aa24.75■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 ABHD16AO95870 558 aa24.75■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 NGFP01138 241 aa24.75■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC6A6P31641 620 aa24.75■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 PTCHD4Q6ZW05 846 aa24.75■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 JAZF1Q86VZ6 243 aa24.75■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 FITM2Q8N6M3 262 aa24.75■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 NSL1Q96IY1 281 aa24.75■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 IFT27Q9BW83 186 aa24.75■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 IL1RAPQ9NPH3 570 aa24.75■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 PLEK2Q9NYT0 353 aa24.75■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 ASH2LQ9UBL3 628 aa24.75■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 SPRY3O43610 288 aa24.74■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 AQP6Q13520 282 aa24.74■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 RFX4Q33E94 735 aa24.74■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 DNM1P34Q6PK57 102 aa24.74■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 OR52D1Q9H346 318 aa24.74■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa24.74■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa24.74■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 ATRQ13535 2644 aa24.73■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 TXNDC12O95881 172 aa24.73■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 SRD5A1P18405 259 aa24.73■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 FPR3P25089 353 aa24.73■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 NOS3P29474 1203 aa24.73■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 TEKQ02763 1124 aa24.73■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 SAP30LQ9HAJ7 183 aa24.73■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa24.72■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 RENP00797 406 aa24.72■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 COX5BP10606 129 aa24.72■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 CRABP1P29762 137 aa24.72■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 C1orf94Q6P1W5 598 aa24.72■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 LEG1Q6P5S2 330 aa24.72■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 USP51Q70EK9 711 aa24.72■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC197Q8NCU1 140 aa24.72■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 CLDND2Q8NHS1 167 aa24.72■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa24.72■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 SAMD8Q96LT4 415 aa24.72■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 TSSK2Q96PF2 358 aa24.72■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 ACTR3BQ9P1U1 418 aa24.72■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 RP2O75695 350 aa24.71■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 GSTM3P21266 225 aa24.71■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 CDH15P55291 814 aa24.71■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 LSM6P62312 80 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 CR1LQ2VPA4 569 aa24.71■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 OR4K13Q8NH42 304 aa24.71■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 CYSLTR2Q9NS75 346 aa24.71■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 TREM2Q9NZC2 230 aa24.71■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa24.7■■□□□ 1.55
SEMA3B-215ENST00000621029 ICMTO60725 284 aa24.7■■□□□ 1.54
SEMA3B-215ENST00000621029 GPANK1O95872 356 aa24.7■■□□□ 1.54
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM107AO95990 144 aa24.7■■□□□ 1.54
SEMA3B-215ENST00000621029 ATP6V1B2P21281 511 aa24.7■■□□□ 1.54
SEMA3B-215ENST00000621029 CRYBB2P43320 205 aa24.7■■□□□ 1.54
SEMA3B-215ENST00000621029 MVKQ03426 396 aa24.7■■□□□ 1.54
SEMA3B-215ENST00000621029 AVPI1Q5T686 147 aa24.7■■□□□ 1.54
SEMA3B-215ENST00000621029 NPEPL1Q8NDH3 523 aa24.7■■□□□ 1.54
SEMA3B-215ENST00000621029 NMNAT3Q96T66 252 aa24.7■■□□□ 1.54
SEMA3B-215ENST00000621029 EGLN1Q9GZT9 426 aa24.7■■□□□ 1.54
SEMA3B-215ENST00000621029 H3BSA7 217 aa24.69■■□□□ 1.54
SEMA3B-215ENST00000621029 TNFRSF11BO00300 401 aa24.69■■□□□ 1.54
SEMA3B-215ENST00000621029 KRT36O76013 467 aa24.69■■□□□ 1.54
SEMA3B-215ENST00000621029 IGHV1-46P01743 117 aa24.69■■□□□ 1.54
SEMA3B-215ENST00000621029 LIPAP38571 399 aa24.69■■□□□ 1.54
SEMA3B-215ENST00000621029 MMP15P51511 669 aa24.69■■□□□ 1.54
SEMA3B-215ENST00000621029 HFEQ30201 348 aa24.69■■□□□ 1.54
SEMA3B-215ENST00000621029 ZMAT1Q5H9K5 638 aa24.69■■□□□ 1.54
SEMA3B-215ENST00000621029 OR1F12Q8NHA8 337 aa24.69■■□□□ 1.54
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC7A6Q92536 515 aa24.69■■□□□ 1.54
SEMA3B-215ENST00000621029 LPAR2Q9HBW0 351 aa24.69■■□□□ 1.54
SEMA3B-215ENST00000621029 TBCCD1Q9NVR7 557 aa24.69■■□□□ 1.54
SEMA3B-215ENST00000621029 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa24.68■■□□□ 1.54
SEMA3B-215ENST00000621029 RNF212BA8MTL3 300 aa24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.3 ms