RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620505.1

TARDBP-222, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 657 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-222	ENST00000620505	IGHV2-70	P01814	119 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	MSR1	P21757	451 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	GATA3	P23771	443 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	KDELR2	P33947	212 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	GPR4	P46093	362 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	HTR5A	P47898	357 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	PCBD1	P61457	104 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	ST3GAL3	Q11203	375 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	KLF10	Q13118	480 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505		Q6ZR03	302 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	NRM	Q8IXM6	262 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	OR5AS1	Q8N127	324 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	PRRC1	Q96M27	445 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505		Q96M85	177 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	SH3GL1	Q99961	368 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	POLE4	Q9NR33	117 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	STARD10	Q9Y365	291 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	AUP1	Q9Y679	476 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	DYSF	O75923	2080 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	GMNC	A6NCL1	334 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505		A6NIZ1	184 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	IMPA2	O14732	288 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	GPANK1	O95872	356 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	IGHM	P01871	453 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	CD55	P08174	381 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	ADH4	P08319	380 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	HKR1	P10072	659 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	THRB	P10828	461 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	NR2C1	P13056	603 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	GSTM3	P21266	225 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	TNFSF4	P23510	183 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	LIPA	P38571	399 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	SLC9A3	P48764	834 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	RAP1B	P61224	184 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	RAP1A	P62834	184 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF154	Q13106	437 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	BAMBI	Q13145	260 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	CDK5R2	Q13319	367 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	FHL1	Q13642	323 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	ZMYND11	Q15326	602 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	MEST	Q5EB52	335 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	OAF	Q86UD1	273 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	OR2T12	Q8NG77	320 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	STON2	Q8WXE9	905 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	DIRC2	Q96SL1	478 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	NTN4	Q9HB63	628 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	NUP50	Q9UKX7	468 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	CDC42EP2	O14613	210 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	FFAR1	O14842	300 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	TMPRSS2	O15393	492 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	SGCE	O43556	437 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF682	O95780	498 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	IGF2	P01344	180 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	IFNW1	P05000	195 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	DBH	P09172	617 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	CTLA4	P16410	223 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF12	P17014	697 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23

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