RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619785.1

SENP3-210, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 3

Gene SENP3, Length 634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-210ENST00000619785 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.11□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 PPIAL4AQ9Y536 164 aa6.11□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 TIMM22Q9Y584 194 aa6.11□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 KCNE3Q9Y6H6 103 aa6.11□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.11□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.1□□□□□ -1.43
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SENP3-210ENST00000619785 VCYO14598 125 aa6.1□□□□□ -1.43
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SENP3-210ENST00000619785 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
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SENP3-210ENST00000619785 TPK1Q9H3S4 243 aa6.1□□□□□ -1.43
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SENP3-210ENST00000619785 NUP50Q9UKX7 468 aa6.1□□□□□ -1.43
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SENP3-210ENST00000619785 M0QZ24 198 aa6.09□□□□□ -1.43
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SENP3-210ENST00000619785 RAD51CO43502 376 aa6.09□□□□□ -1.43
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SENP3-210ENST00000619785 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
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SENP3-210ENST00000619785 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa6.09□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.09□□□□□ -1.43
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SENP3-210ENST00000619785 SLC25A28Q96A46 364 aa6.09□□□□□ -1.43
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SENP3-210ENST00000619785 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
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SENP3-210ENST00000619785 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.08□□□□□ -1.44
SENP3-210ENST00000619785 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.08□□□□□ -1.44
SENP3-210ENST00000619785 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa6.08□□□□□ -1.44
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SENP3-210ENST00000619785 DUXAA6NLW8 204 aa6.08□□□□□ -1.44
SENP3-210ENST00000619785 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.08□□□□□ -1.44
SENP3-210ENST00000619785 TIMM23O14925 209 aa6.08□□□□□ -1.44
SENP3-210ENST00000619785 LSM1O15116 133 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
SENP3-210ENST00000619785 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
SENP3-210ENST00000619785 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
SENP3-210ENST00000619785 UPK3AO75631 287 aa6.08□□□□□ -1.44
SENP3-210ENST00000619785 NGFP01138 241 aa6.08□□□□□ -1.44
SENP3-210ENST00000619785 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
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