RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612197.1

RNU6-1192P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1192, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1192P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1192P-201ENST00000612197 CDH6P55285 790 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 PRR3P79522 188 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 CDC20Q12834 499 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 COX19Q49B96 90 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 SLC8B1Q6J4K2 584 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 ZYG11AQ6WRX3 759 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 CDH26Q8IXH8 852 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 LGI3Q8N145 548 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 OSR2Q8N2R0 312 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 OR10AD1Q8NGE0 317 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 RNF139Q8WU17 664 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 OR10C1Q96KK4 312 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 OR5B12Q96R08 314 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 RNF5Q99942 180 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 SPNS1Q9H2V7 528 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 WFDC1Q9HC57 220 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 VANGL2Q9ULK5 521 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 CLOCKO15516 846 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 RCBTB2O95199 551 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 CEACAM3P40198 252 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 PRMT2P55345 433 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 CDH17Q12864 832 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 RCAN2Q14206 197 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 PPP1R7Q15435 360 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 CHRFAM7AQ494W8 412 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 SOHLH1Q5JUK2 328 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 SAXO2Q658L1 398 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 TAS2R42Q7RTR8 314 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 IQCKQ8N0W5 287 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 NPWQ8N729 165 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 NECAP1Q8NC96 275 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 OR56B2PQ8NGI1 322 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 OR6N1Q8NGY5 312 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 COQ8AQ8NI60 647 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 PIFOQ8TCI5 191 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 RASD2Q96D21 266 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 CNDP1Q96KN2 507 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 LINC00477Q96M19 166 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 COL21A1Q96P44 957 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 NUP58Q9BVL2 599 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 ANKRA2Q9H9E1 313 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 CTSFQ9UBX1 484 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP2.56□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 TRAV40A0A0B4J280 105 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 C7orf66A4D0T2 115 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 GOLGA8OA6NCC3 632 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 GOLGA8NF8WBI6 632 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 CCNE2O96020 404 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 APCSP02743 223 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 DCNP07585 359 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 CD3GP09693 182 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 ACSM4P0C7M7 580 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 SSTR5P35346 364 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 OPRK1P41145 380 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 PRSS8Q16651 343 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 ORMDL2Q53FV1 153 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 SMUG1Q53HV7 270 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 AVPI1Q5T686 147 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 OR4K5Q8NGD3 323 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 NTAN1Q96AB6 310 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 CAMK2N2Q96S95 79 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 ZNF382Q96SR6 550 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 CENPKQ9BS16 269 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 OSBPL11Q9BXB4 747 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 OR52D1Q9H346 318 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 FAM49BQ9NUQ9 324 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 LGALS13Q9UHV8 139 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 YEATS2Q9ULM3 1422 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 TSPOAP1O95153 1857 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 OR2AG2A6NM03 316 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 K7EMT4 169 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 OR2J3O76001 311 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 AQP8O94778 261 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 SNX4O95219 450 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 SERPINE2P07093 398 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 CTSLP07711 333 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 POLR2MP0CAP2 368 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 ATF6P18850 670 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 CACNG7P62955 275 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 PPM1LQ5SGD2 360 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 UBE2UQ5VVX9 321 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 NEGR1Q7Z3B1 354 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1192P-201ENST00000612197 TMEM150AQ86TG1 271 aa2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms