RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 THRBP10828 461 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 GSTM3P21266 225 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 KITLGP21583 273 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 MSR1P21757 451 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 TUBG1P23258 451 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 OR1E2P47887 323 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 DEFA6Q01524 100 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 PAX8Q06710 450 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC9A3R2Q15599 337 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ESCO2Q56NI9 601 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 AGBL2Q5U5Z8 902 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM205BPQ63HN1 556 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 NANOGP8Q6NSW7 305 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC75AQ8NAA5 344 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 NPEPL1Q8NDH3 523 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 OR2Z1Q8NG97 314 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ITLN1Q8WWA0 313 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 POFUT1Q9H488 388 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 TUBG2Q9NRH3 451 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 TBCCD1Q9NVR7 557 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 IL19Q9UHD0 177 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 DOCK11Q5JSL3 2073 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 HTR3EA5X5Y0 456 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 A6NIZ1 184 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 CEACAM18A8MTB9 384 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 C12orf71A8MTZ7 269 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 SCG5P05408 212 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 PPIAL4GP0DN37 164 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 MDH2P40926 338 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 CTXN1P60606 82 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 RAP1BP61224 184 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 RAP1AP62834 184 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 PAX2Q02962 417 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 RABL3Q5HYI8 236 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 LEG1Q6P5S2 330 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 IGFN1Q86VF2 1251 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 CALHM3Q86XJ0 350 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 PARP8Q8N3A8 854 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 OR52E2Q8NGJ4 325 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 DYDC1Q8WWB3 177 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 BPIFA2Q96DR5 249 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 OR2V2Q96R30 315 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 WACQ9BTA9 647 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 SLITRK2Q9H156 845 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 POLE4Q9NR33 117 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 OR5V1Q9UGF6 321 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 IL20RAQ9UHF4 553 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 LRCH1Q9Y2L9 728 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 TGP01266 2768 aa8.65□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM178BH3BS89 294 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 FBP2O00757 339 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 SURF4O15260 269 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 DOK2O60496 412 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 PLATP00750 562 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 WNT2P09544 360 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 IFI30P13284 250 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 CPT2P23786 658 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 CD80P33681 288 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 HTR5AP47898 357 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 MTNR1AP48039 350 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 MMP16P51512 607 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 SCRN3Q0VDG4 424 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 ST3GAL3Q11203 375 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 FHL1Q13642 323 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 OR8J3Q8NGG0 315 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 UPRTQ96BW1 309 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 HAVCR1Q96D42 359 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 CMBLQ96DG6 245 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 PRRC1Q96M27 445 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 SH3GL1Q99961 368 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 ECSITQ9BQ95 431 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 GCM1Q9NP62 436 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 EMC7Q9NPA0 242 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 A4GNTQ9UNA3 340 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 STARD10Q9Y365 291 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 TRAV27A0A087WT01 109 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 TRAV40A0A0B4J280 105 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 H7C1C5 153 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 IFNL4K9M1U5 179 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 FXYD1O00168 92 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 SGCEO43556 437 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 IFNA14P01570 189 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 MDKP21741 143 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 FUT4P22083 530 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-226ENST00000593200 ERFP50548 548 aa8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms