RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593111.1

PSME3-216, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene PSME3, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-216ENST00000593111 A0A0G2JND7 137 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 A0A1W2PPL8 197 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 POM121CA8CG34 1229 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 TNFRSF1AP19438 455 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 TNFRSF1BP20333 461 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 NFYCQ13952 458 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 TUSC1Q2TAM9 212 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 TMEM155Q4W5P6 130 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 CLDN22Q8N7P3 220 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 SAMD8Q96LT4 415 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 TANC2Q9HCD6 1990 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 EBAG9O00559 213 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 ABHD16AO95870 558 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 GSTM3P21266 225 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 BTG1P62324 171 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 ZMYND11Q15326 602 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 ZSCAN26Q16670 478 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 VMACQ2NL98 169 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 ESCO2Q56NI9 601 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 ALG10Q5BKT4 473 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 ZNF283Q8N7M2 679 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 OR52E2Q8NGJ4 325 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 ALG12Q9BV10 488 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 OR5V1Q9UGF6 321 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 MED31Q9Y3C7 131 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 NPIPB13A6NJU9 1138 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 C12orf71A8MTZ7 269 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 NPIPB4C9JG80 1138 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 ICMTO60725 284 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 DCTN3O75935 186 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 OR5F1O95221 314 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 GPANK1O95872 356 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 TSPAN19P0C672 248 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 MTNR1AP48039 350 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 CRYBA2P53672 197 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 RPL27P61353 136 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 SLC9A3R2Q15599 337 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 LEG1Q6P5S2 330 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 CCDC80Q76M96 950 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 JAZF1Q86VZ6 243 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 LIPHQ8WWY8 451 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 CMBLQ96DG6 245 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 BAG5Q9UL15 447 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 SURF4O15260 269 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 IGF2P01344 180 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 CD80P33681 288 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 OR1E2P47887 323 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 CTXN1P60606 82 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 PAX8Q06710 450 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 MIDNQ504T8 468 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 Q6ZR03 302 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 IGFN1Q86VF2 1251 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 FNDC8Q8TC99 324 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 ITLN1Q8WWA0 313 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 POFUT1Q9H488 388 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 TBCCD1Q9NVR7 557 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 IL19Q9UHD0 177 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 VWFP04275 2813 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 ERICH4A6NGS2 130 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 CLDN34H7C241 214 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 PIP5K1CO60331 668 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 MDKP21741 143 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 MSR1P21757 451 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 OMGP23515 440 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 MDH2P40926 338 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 GZMMP51124 257 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 SYT9Q86SS6 491 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 PARP8Q8N3A8 854 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 NPEPL1Q8NDH3 523 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 SLITRK2Q9H156 845 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 EMC7Q9NPA0 242 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 HIF3AQ9Y2N7 669 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 STARD10Q9Y365 291 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 A8MXK9 166 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 F5H0A9 414 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 TMEM178BH3BS89 294 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 THRBP10828 461 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 IFI30P13284 250 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 KITLGP21583 273 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 TUBG1P23258 451 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 HTR5AP47898 357 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 C1orf94Q6P1W5 598 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME3-216ENST00000593111 C16orf87Q6PH81 154 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms