RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 TRILQ7L0X0 811 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 PIP4P1Q86T03 277 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 ANKRD53Q8N9V6 530 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 SDR9C7Q8NEX9 313 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 OR2M3Q8NG83 312 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 RELTQ969Z4 430 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 FAM60AQ9NP50 221 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 MBD2Q9UBB5 411 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 CD300AQ9UGN4 299 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 THBS4P35443 961 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 RNFT1Q5M7Z0 435 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM65Q6PI78 240 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 Q6ZSR9 355 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 ELMOD2Q8IZ81 293 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 TOMM5Q8N4H5 51 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF519Q8TB69 540 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 POC1BQ8TC44 478 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 OR52A1Q9UKL2 312 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 STUB1Q9UNE7 303 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 MGAMO43451 1857 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 TP73O15350 636 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 P2RX6O15547 441 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 F13BP05160 661 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 RAB3BP20337 219 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 KIR2DS2P43631 304 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 GIPRP48546 466 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 TNFSF10P50591 281 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 WNT4P56705 351 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 SLC37A1P57057 533 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 PPP1CBP62140 327 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 TLE1Q04724 770 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 DMTNQ08495 405 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 SPHARQ15513 63 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 ACKR1Q16570 336 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 SLCO6A1Q86UG4 719 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 GPR119Q8TDV5 335 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 MIB2Q96AX9 1013 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 GRAMD2BQ96HH9 432 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 ADTRPQ96IZ2 230 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 OR51B6Q9H340 312 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 RNF7Q9UBF6 113 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 A0A1W2PNR3 127 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 FABP12A6NFH5 140 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 FAM25EA8MYX2 175 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 E9PI62 339 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 ENSAO43768 121 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 CNIH1O95406 144 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 ETHE1O95571 254 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 OPN1LWP04000 364 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 LIPFP07098 398 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 GRPP07492 148 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 CBR1P16152 277 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 SOX2P48431 317 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 SLC25A1P53007 311 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 RAB11AP62491 216 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 PIGFQ07326 219 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 IGFBP7Q16270 282 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 VMA21Q3ZAQ7 101 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 TIMM23BQ5SRD1 257 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 STEAP3Q658P3 488 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 GCNT2Q8N0V5 402 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 WDSUB1Q8N9V3 476 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 CYB561A3Q8NBI2 242 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 FDCSPQ8NFU4 85 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 RDH5Q92781 318 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 EID2BQ96D98 161 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM231Q9H6L2 316 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 ATPIF1Q9UII2 106 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 CES1P1Q9UKY3 287 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa5.65□□□□□ -1.51
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SMAD4-212ENST00000591126 CT45A6P0DMU7 189 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 CT45A5P0DMU8 189 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 CT45A7P0DMV0 189 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 CT45A8P0DMV1 189 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 CT45A9P0DMV2 189 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 COX5BP10606 129 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 AGAP20933 346 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 ERVFRD-1P60508 538 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 DUSP2Q05923 314 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 CT45A2Q5DJT8 189 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 CT45A1Q5HYN5 189 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM69Q5SWH9 247 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 CDCP2Q5VXM1 449 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 CT45A3Q8NHU0 189 aa5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
SMAD4-212ENST00000591126 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa5.65□□□□□ -1.51
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