RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 PARPBPQ9NWS1 579 aa5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 GALNT8Q9NY28 637 aa5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ASH2LQ9UBL3 628 aa5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC5A6Q9Y289 635 aa5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 POLR1DQ9Y2S0 133 aa5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 LHFPL6Q9Y693 200 aa5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 COL6A6A6NMZ7 2263 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 DAPL1A0PJW8 107 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CIB4A0PJX0 185 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC22A31A6NKX4 558 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 A8MXE2 369 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 E9PI62 339 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 C19orf84I3L1E1 186 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 J3QRE1 110 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 LALBAP00709 142 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PTHP01270 115 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 DBHP09172 617 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 LIMS3P0CW19 117 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 LIMS4P0CW20 117 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC2A1P11166 492 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CD79AP11912 226 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF823P16415 610 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 MSR1P21757 451 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CRABP1P29762 137 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 OPRM1P35372 400 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ENTPD1P49961 510 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 OR12D2P58182 307 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CXCR4P61073 352 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC35A2P78381 396 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 HGFACQ04756 655 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP5.26□□□□□ -1.571e-11■■■■■ 33.4
CAPNS1-208ENST00000589162 NEDD8Q15843 81 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 GABRA6Q16445 453 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC35D3Q5M8T2 416 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A30Q5SVS4 291 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SFRP5Q5T4F7 317 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 MEDAGQ5VYS4 303 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM211Q6ICI0 200 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 OR7E24Q6IFN5 339 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF774Q6NX45 483 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 DNM1P34Q6PK57 102 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 STAC2Q6ZMT1 411 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC16A9Q7RTY1 509 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 HDDC2Q7Z4H3 204 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 DCXRQ7Z4W1 244 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 MRGPRGQ86SM5 289 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 NAA40Q86UY6 237 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 MDP1Q86V88 176 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CDC20BQ86Y33 519 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SPARTQ8N0X7 666 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 STX19Q8N4C7 294 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC22A24Q8N4F4 322 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR31Q8NA23 367 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 POMGNT2Q8NAT1 580 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 OR10H5Q8NGA6 315 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 HSD17B8Q92506 261 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 S100PBPQ96BU1 408 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 POM121Q96HA1 1249 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM80Q96HE8 168 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 Q96MT0 163 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 OR5M11Q96RB7 305 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SIGLEC11Q96RL6 698 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF649Q9BS31 505 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ABHD6Q9BV23 337 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SFXN3Q9BWM7 321 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 WNT5BQ9H1J7 359 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 OR51B6Q9H340 312 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 DUSP21Q9H596 190 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF121Q9H920 327 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 MARCH7Q9H992 704 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 GP6Q9HCN6 339 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CENPMQ9NSP4 180 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ERVK13-1Q9NX77 482 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SCN3BQ9NY72 215 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 MALT1Q9UDY8 824 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 IKZF2Q9UKS7 526 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXL3Q9UKT7 428 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP5.26□□□□□ -1.57
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