RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 CLUP10909 449 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 CD99P14209 185 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF823P16415 610 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF23P17027 643 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 FMO3P31513 532 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 GRK5P34947 590 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 GLRXP35754 106 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 RAD52P43351 418 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 CRISP1P54107 249 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 ACTR3P61158 418 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 ERVS71-1P61550 626 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 CDK5Q00535 292 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 MSMPQ1L6U9 139 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 ALKBH6Q3KRA9 238 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 C11orf71Q6IPW1 123 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC27A4Q6P1M0 643 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 LURAP1LQ8IV03 231 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00346Q8IVM7 164 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 C10orf67Q8IYJ2 551 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 PROKR2Q8NFJ6 384 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 GJC3Q8NFK1 279 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 OR1J1Q8NGS3 322 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 OR2T4Q8NH00 348 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC7A6Q92536 515 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 PTP4A1Q93096 173 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 Q96MF0 132 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 DOK1Q99704 481 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 PKP2Q99959 881 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 SYT3Q9BQG1 590 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 WACQ9BTA9 647 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 GSX2Q9BZM3 304 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 GRIP2Q9C0E4 1043 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 OR51V1Q9H2C8 321 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 C1orf198Q9H425 327 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 PLK3Q9H4B4 646 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF442Q9H7R0 627 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 KRT84Q9NSB2 600 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 PLEK2Q9NYT0 353 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 TVP23BQ9NYZ1 205 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 ASH2LQ9UBL3 628 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 POLR1DQ9Y2S0 133 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 LHFPL6Q9Y693 200 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 AKAP6Q13023 2319 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD65E5RJM6 399 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 LY6HO94772 140 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 NGFP01138 241 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHV4-39P01824 125 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 HMGN1P05114 100 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 DBHP09172 617 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 GAAP10253 952 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 FCGR1AP12314 374 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 PAX1P15863 534 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF3P17036 446 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 SPI1P17947 270 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 PCSK6P29122 969 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 WNT5AP41221 380 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 RPS27P42677 84 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 HTR5AP47898 357 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 NUDT6P53370 316 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 SELENOVP59797 346 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 GLO1Q04760 184 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 SCRN3Q0VDG4 424 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 AQP6Q13520 282 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 SNAPC1Q16533 368 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 CLEC12BQ2HXU8 276 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 SPATA46Q5T0L3 261 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 PLBD1Q6P4A8 553 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 FAHD1Q6P587 224 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 ARL9Q6T311 187 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 LYPD4Q6UWN0 246 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 PRSS57Q6UWY2 283 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 NAA40Q86UY6 237 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 CPOQ8IVL8 374 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF101Q8IZC7 436 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF511Q8NB15 262 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC26A10Q8NG04 563 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 OR6K6Q8NGW6 343 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 OR1F12Q8NHA8 337 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 ABHD4Q8TB40 342 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-211ENST00000588374 SYNPRQ8TBG9 265 aa5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms