RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF823P16415 610 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ADH6P28332 368 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 BDKRB2P30411 391 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 PMELP40967 661 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 KIR3DL2P43630 455 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 TAS2R46P59540 309 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 TAF13Q15543 124 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 MEP1BQ16820 701 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 HFEQ30201 348 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 MESTQ5EB52 335 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 AVPI1Q5T686 147 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 DCAF12L2Q5VW00 463 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 MTFR2Q6P444 385 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 NPSR1Q6W5P4 371 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF627Q7L945 461 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 DPY19L4Q7Z388 723 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ZAR1Q86SH2 424 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF615Q8N8J6 731 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 OR10G6Q8NH81 332 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 C16orf52Q8NHV5 167 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF519Q8TB69 540 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ASB5Q8WWX0 329 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF285Q96NJ3 590 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 AQP10Q96PS8 301 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 TSPAN32Q96QS1 320 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM117AQ9C073 453 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 SYT4Q9H2B2 425 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 TUBA4BQ9H853 241 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 RNF122Q9H9V4 155 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 HRASLS2Q9NWW9 162 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 MSRAQ9UJ68 235 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 B9D1Q9UPM9 204 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 POM121CA8CG34 1229 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 A8MUA0 341 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ALG1L2C9J202 215 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 PRSS44E7EML9 344 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 F8W036 122 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ADAM11O75078 769 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 UTS2O95399 124 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 AHSA1O95433 338 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 SIX6O95475 246 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 HLA-DQA2P01906 255 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 BGLAPP02818 100 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 FCARP24071 287 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 CD1CP29017 333 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB5CP51148 216 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 CCR5P51681 352 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 PNLIPRP2P54317 469 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ID2Q02363 134 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 DMWDQ09019 674 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 GLYATL3Q5SZD4 288 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 GRINAQ7Z429 371 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 MDGA2Q7Z553 956 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ST8SIA1Q92185 356 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 C8orf44Q96CB5 159 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ARSGQ96EG1 525 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 MAP3K3Q99759 626 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 FANCFQ9NPI8 374 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 COQ3Q9NZJ6 369 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 KPTNQ9Y664 436 aa6.95□□□□□ -1.3
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