RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	MARCH7	Q9H992	704 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	MMP25	Q9NPA2	562 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	KLHL1	Q9NR64	748 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	INIP	Q9NRY2	104 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	STARD5	Q9NSY2	213 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CKLF	Q9UBR5	152 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	GNG8	Q9UK08	70 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	FKBP7	Q9Y680	259 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289		V9GY05	133 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM131	Q92545	1883 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	HTT	P42858	3142 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CEP350	Q5VT06	3117 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A0A6YYH2	397 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A0G2JMP0	313 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A0X1KG70	313 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A1B0GX78	115 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A1W2PRG6	482 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	C7orf66	A4D0T2	115 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289		A6NJ64	397 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	IFITM5	A6NNB3	132 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR171	O14626	319 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	YKT6	O15498	198 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SCGN	O76038	276 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	MT-CO3	P00414	261 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	HRG	P04196	525 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	IGKV3-11	P04433	115 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	TCRB	P04435	133 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CD2	P06729	351 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CD63	P08962	238 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	NPIPA8	P0DM63	369 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	NR2C1	P13056	603 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ARSB	P15848	533 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ALOX5AP	P20292	161 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	MAOA	P21397	527 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	UQCRC1	P31930	480 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	P2RX1	P51575	399 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	STARD6	P59095	220 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ERVK-25	P63136	954 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	BTG2	P78543	158 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	GLO1	Q04760	184 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ZP4	Q12836	540 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SKP2	Q13309	424 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR176	Q14439	515 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	NSDHL	Q15738	373 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SGCB	Q16585	318 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	LEG1	Q6P5S2	330 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	KRT74	Q7RTS7	529 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM122B	Q7Z309	247 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	GRINA	Q7Z429	371 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	NRAC	Q8N912	160 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	OR8K3	Q8NH51	312 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ST8SIA1	Q92185	356 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	MIB2	Q96AX9	1013 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76

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