RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563830.2

SNAP23-208, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5

Gene SNAP23, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-208	ENST00000563830	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	NRGN	Q92686	78 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	TMEM230	Q96A57	120 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	OPALIN	Q96PE5	141 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	PTPRT	O14522	1441 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	SMKR1	H3BMG3	65 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	DFNA5	O60443	496 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	UQCRFS1	P47985	274 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	AVPI1	Q5T686	147 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	STARD4	Q96DR4	205 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	MICU1	Q9BPX6	476 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	PSG11	Q9UQ72	335 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	OR6C74	A6NCV1	312 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	RAD51C	O43502	376 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	GABARAP	O95166	117 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	IGKV3-11	P04433	115 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	BCHE	P06276	602 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ACSM4	P0C7M7	580 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	RSPH10B	P0C881	870 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ANXA8	P13928	327 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ATF6	P18850	670 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ZNF138	P52744	262 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	CDH17	Q12864	832 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	SELENBP1	Q13228	472 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	KIR2DS1	Q14954	304 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ZNF726P1	Q15940	193 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	C5orf47	Q569G3	176 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	UBALD1	Q8TB05	177 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830		A0A1B0GVX0	72 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	OR2AG2	A6NM03	316 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	YIF1A	O95070	293 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	IGKV2D-28	P01615	120 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	HLA-H	P01893	362 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ARG1	P05089	322 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	FGF4	P08620	206 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ERG	P11308	486 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	TCN2	P20062	427 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	BCKDHB	P21953	392 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	KDSR	Q06136	332 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	GTF3C1	Q12789	2109 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	PON2	Q15165	354 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	CHST4	Q8NCG5	386 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	BBOF1	Q8ND07	529 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	C9orf72	Q96LT7	481 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	RNF157	Q96PX1	679 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	CLN6	Q9NWW5	311 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830		A0A1W2PP18	115 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNAP23-208	ENST00000563830		A0A1W2PRD5	423 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNAP23-208	ENST00000563830	CIB4	A0PJX0	185 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNAP23-208	ENST00000563830	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		3.08	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms