RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R2P9	O14990	202 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF749	O43361	778 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SEMA3D	O95025	777 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TDP2	O95551	362 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CLIC3	O95833	236 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ORM1	P02763	201 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	IFNA6	P05013	189 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ACSM4	P0C7M7	580 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PET100	P0DJ07	73 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CT45A10	P0DMU9	189 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF35	P13682	527 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	HSD17B1	P14061	328 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SELE	P16581	610 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	HLA-G	P17693	338 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB4A	P20338	218 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MAG	P20916	626 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CMA1	P23946	247 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	EPHX2	P34913	555 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R2	P41236	205 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	RANBP1	P43487	201 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	KIR2DS2	P43631	304 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ALDH3B2	P48448	385 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	NUP107	P57740	925 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MLF1	P58340	268 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	REEP5	Q00765	189 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PUDP	Q08623	228 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	BNIP2	Q12982	314 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	GGTLC2	Q14390	218 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CCL14	Q16627	93 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	BSX	Q3C1V8	233 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CPTP	Q5TA50	214 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957		Q6ZSR9	355 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	AHSA2	Q719I0	299 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	HOGA1	Q86XE5	327 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	STPG2	Q8N412	459 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PNKD	Q8N490	385 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MDS2	Q8NDY4	140 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	LFNG	Q8NES3	379 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TTL	Q8NG68	377 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OR56B4	Q8NH76	319 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	RFESD	Q8TAC1	157 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	FGF14	Q92915	247 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	NABP1	Q96AH0	204 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB3C	Q96E17	227 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR34	Q96EX3	536 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MBOAT7	Q96N66	472 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	RANBP9	Q96S59	729 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	LGMN	Q99538	433 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXC2	Q99958	501 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	APOL4	Q9BPW4	351 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CENPH	Q9H3R5	247 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	IL17C	Q9P0M4	197 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CFL2	Q9Y281	166 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ASF1A	Q9Y294	204 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		2.23	□□□□□ -2.05

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