RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557454.1

NEDD1-211, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-211ENST00000557454 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 OR2T1O43869 369 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 IRF2P14316 349 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 ZNF32P17041 273 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 TAC1P20366 129 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 IMPDH1P20839 514 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 MYF6P23409 242 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 ECI1P42126 302 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 SRP9P49458 86 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 ARHGDIAP52565 204 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 PUDPQ08623 228 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 GNA13Q14344 377 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 IL23RQ5VWK5 629 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 FGFRL1Q8N441 504 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 ANKFN1Q8N957 763 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 ST8SIA4Q92187 359 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 TNFRSF14Q92956 283 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 CMBLQ96DG6 245 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 ZNF649Q9BS31 505 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 TBCCD1Q9NVR7 557 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 CDHR4A6H8M9 788 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 F5H5P2 479 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 DVL1O14640 695 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 QDPRP09417 244 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 RGS6P49758 472 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 ZNF75DP51815 510 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 SYPL1Q16563 259 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 GALNTL6Q49A17 601 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 ZNF836Q6ZNA1 936 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 CMTM4Q8IZR5 234 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 CLECL1Q8IZS7 167 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 Q8N7P7 452 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 PIFOQ8TCI5 191 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 SLC38A4Q969I6 547 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 L3HYPDHQ96EM0 354 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 SLC41A3Q96GZ6 507 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 AJUBAQ96IF1 538 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 C4orf45Q96LM5 186 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 ELOVL3Q9HB03 270 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 NANSQ9NR45 359 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 ATAD3AQ9NVI7 634 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 JRKLQ9Y4A0 524 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 SLC28A1O00337 649 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 LSM1O15116 133 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 SLC25A17O43808 307 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 FAM20BO75063 409 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 GLRA3O75311 464 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 ABHD16AO95870 558 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 ECDO95905 644 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 DBIP07108 87 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 GSTA1P08263 222 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 RPL3P39023 403 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 THBS3P49746 956 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 UBE2E1P51965 193 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 PRKAA2P54646 552 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 HOXC5Q00444 222 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 PSG4Q00888 419 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 IL5RAQ01344 420 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 ACSM1Q08AH1 577 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 MELKQ14680 651 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 PTGR1Q14914 329 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 NPTX1Q15818 432 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 AANATQ16613 207 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 SYT9Q86SS6 491 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 SERPINA11Q86U17 422 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 TMEM219Q86XT9 240 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 CCNYL1Q8N7R7 359 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 NPEPL1Q8NDH3 523 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 OR6X1Q8NH79 312 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 FBXO25Q8TCJ0 367 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 ZNF566Q969W8 418 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 TEX37Q96LM6 180 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 OSBPL9Q96SU4 736 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 MEAF6Q9HAF1 191 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 TMED5Q9Y3A6 229 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 MUC4Q99102 2169 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 WDR91A4D1P6 747 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 C11orf98E9PRG8 122 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 LGALS8O00214 317 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 F2RL2O00254 374 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 HMGN4O00479 90 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 MLNRO43193 412 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD1-211ENST00000557454 LY6G6CO95867 125 aa7.54□□□□□ -1.2
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