RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TEX30	Q5JUR7	227 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	OR2A2	Q6IF42	318 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ARL9	Q6T311	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067		Q6ZS92	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SPATC1	Q76KD6	591 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TRIL	Q7L0X0	811 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	CDC20B	Q86Y33	519 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	EXD3	Q8N9H8	876 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	OTOS	Q8NHW6	89 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	THRSP	Q92748	146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	MCHR2	Q969V1	340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM45B	Q96B21	275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	C1orf159	Q96HA4	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ADGRG7	Q96K78	797 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	C4orf36	Q96KX1	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	KCTD7	Q96MP8	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	OPALIN	Q96PE5	141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	OR2M2	Q96R28	347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TIMP4	Q99727	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	MARCH7	Q9H992	704 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	WASF3	Q9UPY6	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF175	Q9Y473	711 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	FRYL	O94915	3013 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	CEP250	Q9BV73	2442 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067		A0A1B0GVC2	190 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF716	A6NP11	495 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF724	A8MTY0	619 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	AHRR	A9YTQ3	701 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	DCTN6	O00399	190 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	DHH	O43323	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	GPRIN2	O60269	458 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	RAMP1	O60894	148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF432	O94892	652 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	APOC1	P02654	83 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TF	P02787	698 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ALOX5AP	P20292	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	MSR1	P21757	451 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	GAL	P22466	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	NR4A1	P22736	598 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	HSD11B1	P28845	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	PTGER4	P35408	488 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	UGT2B10	P36537	528 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TGFBR2	P37173	567 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TGM4	P49221	684 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	OR12D2	P58182	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	PCBD1	P61457	104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	VBP1	P61758	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	PMP22	Q01453	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SLC3A1	Q07837	685 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	LSAMP	Q13449	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	HIST3H3	Q16695	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	C10orf128	Q5T292	105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	LUZP2	Q86TE4	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	PHC2	Q8IXK0	858 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TIGD4	Q8IY51	512 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	OR52N5	Q8NH56	324 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	RNF128	Q8TEB7	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	EXTL1	Q92935	676 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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