RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553876.2

RBM23-208, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 267 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-208	ENST00000553876	MICU1	Q9BPX6	476 aa		2.58	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		2.58	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		2.58	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		2.58	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	SMKR1	H3BMG3	65 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	CACNG3	O60359	315 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	ENTPD5	O75356	428 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	FGF4	P08620	206 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	ANXA8	P13928	327 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF32	P17041	273 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	GGT1	P19440	569 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	ATP5O	P48047	213 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	RAB9A	P51151	201 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	CRISP1	P54107	249 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	RAP1A	P62834	184 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	ARG2	P78540	354 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	IL18	Q14116	193 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	RGN	Q15493	299 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	NUBPL	Q8TB37	319 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	SEH1L	Q96EE3	360 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	RETN	Q9HD89	108 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876		A0A1B0GVX0	72 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876		A0A1B0GW55	424 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876		A0A1W2PP18	115 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	AIRE	O43918	545 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	CCNB2	O95067	398 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	IGKV3-11	P04433	115 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	ARG1	P05089	322 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	BCHE	P06276	602 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	CT45A6	P0DMU7	189 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	CT45A5	P0DMU8	189 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	CT45A7	P0DMV0	189 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	PGAM1	P18669	254 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	PFN3	P60673	137 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	SLA	Q13239	276 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	PON2	Q15165	354 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	QPRT	Q15274	297 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	XKR4	Q5GH76	650 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF691	Q5VV52	312 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	GPR107	Q5VW38	600 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	PLET1	Q6UQ28	207 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	C15orf56	Q8N910	161 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	BBOF1	Q8ND07	529 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	OR5W2	Q8NH69	310 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	ABHD3	Q8WU67	409 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	NTAN1	Q96AB6	310 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF681	Q96N22	645 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	CTSF	Q9UBX1	484 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	DUX4	Q9UBX2	424 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF222	Q9UK12	451 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	INSR	P06213	1382 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	TEX46	H3BTG2	121 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876		H7C0C1	242 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	RAD51C	O43502	376 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	GSTM3	P21266	225 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	OR1E1	P30953	314 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	ILK	Q13418	452 aa		2.55	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms