RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550144.1

CTDSP2-206, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 4

Gene CTDSP2, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-206ENST00000550144 LRRC18Q8N456 261 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-206ENST00000550144 SLC22A24Q8N4F4 322 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-206ENST00000550144 ST7LQ8TDW4 575 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-206ENST00000550144 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-206ENST00000550144 SLAMF6Q96DU3 332 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-206ENST00000550144 PELI1Q96FA3 418 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-206ENST00000550144 FUNDC2Q9BWH2 189 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-206ENST00000550144 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-206ENST00000550144 KCNN2Q9H2S1 579 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-206ENST00000550144 ACOXLQ9NUZ1 547 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-206ENST00000550144 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-206ENST00000550144 CEPT1Q9Y6K0 416 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-206ENST00000550144 E9PI62 339 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 ZNF254O75437 659 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 TNFSF13O75888 250 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 TOXO94900 526 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 ABHD16AO95870 558 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 H2BFMP0C1H6 154 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 GLI4P10075 376 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 CELP19835 753 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 MPGP29372 298 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 TGFBR2P37173 567 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 RIDAP52758 137 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 TMBIM6P55061 237 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 CASP6P55212 293 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 PCBD1P61457 104 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 GPR50Q13585 617 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 SSX1Q16384 188 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 CCDC58Q4VC31 144 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 C9orf135Q5VTT2 229 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 LIPNQ5VXI9 398 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 FOXB2Q5VYV0 432 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 VWA1Q6PCB0 445 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 DEGS2Q6QHC5 323 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 KLHL24Q6TFL4 600 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 LRRN1Q6UXK5 716 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 CFAP77Q6ZQR2 320 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 ZNF627Q7L945 461 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 SLC16A14Q7RTX9 510 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 PHC2Q8IXK0 858 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 RPRMLQ8N4K4 120 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 ZFP41Q8N8Y5 198 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 GJC3Q8NFK1 279 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 RNF133Q8WVZ7 376 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 MAP6Q96JE9 813 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 SH3GL3Q99963 347 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 WACQ9BTA9 647 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 ELOVL3Q9HB03 270 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 CENPMQ9NSP4 180 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 NDUFB11Q9NX14 153 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 TINAGQ9UJW2 476 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 PROCRQ9UNN8 238 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 TENM4Q6N022 2769 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 ZNF878C9JN71 531 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 RER1O15258 196 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 RPP14O95059 124 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 GADD45AP24522 165 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 CTSSP25774 331 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 PSMB10P40306 273 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 OPRL1P41146 370 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 TGM4P49221 684 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 HIST1H3AP68431 136 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 TGFBR3Q03167 851 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 SCRN3Q0VDG4 424 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 NFATC3Q12968 1075 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 TAF13Q15543 124 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 OR7E24Q6IFN5 339 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 ZNF544Q6NX49 715 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 ANKRD16Q6P6B7 361 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 ARL9Q6T311 187 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 Q6ZT83 130 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 HIST2H3AQ71DI3 136 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 RHOUQ7L0Q8 258 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 BTLAQ7Z6A9 289 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 SYT9Q86SS6 491 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 RAB2BQ8WUD1 216 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 ISOC1Q96CN7 298 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 STARD4Q96DR4 205 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 FBXO17Q96EF6 278 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 SFXN3Q9BWM7 321 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 ENPP5Q9UJA9 477 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 LRP12Q9Y561 859 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-206ENST00000550144 BSNQ9UPA5 3926 aa10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms