RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547031.5

KRT8-208, Transcript of keratin 8, human

TSL 2

Gene KRT8, Length 883 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRT8-208	ENST00000547031	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	RERGL	Q9H628	205 aa		13.91	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	EMC7	Q9NPA0	242 aa		13.91	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		13.91	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		13.91	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031		A0A1W2PRQ8	180 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	PRSS37	A4D1T9	235 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	ABHD16A	O95870	558 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	RHCE	P18577	417 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	PRDX6	P30041	224 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	HTR5A	P47898	357 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	LMO4	P61968	165 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	DGCR6	Q14129	220 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	MEST	Q5EB52	335 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	C3orf56	Q8N813	242 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	RAB1C	Q92928	201 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRT8-208	ENST00000547031	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	SGCE	O43556	437 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	DOK2	O60496	412 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	NGF	P01138	241 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	IGHV1-46	P01743	117 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	COX5B	P10606	129 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	GSTM3	P21266	225 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	SDHA	P31040	664 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	MMP15	P51511	669 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	SLC3A1	Q07837	685 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	FAM122B	Q7Z309	247 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	CCL17	Q92583	94 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	RASD2	Q96D21	266 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	DIRC2	Q96SL1	478 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	UNC119B	A6NIH7	251 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	SOCS2	O14508	198 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	ATP8B1	O43520	1251 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	SLC16A7	O60669	478 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	ICMT	O60725	284 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	SCG5	P05408	212 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	SMIM11A	P58511	58 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	TEX29	Q8N6K0	151 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	RNF148	Q8N7C7	305 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	SYT4	Q9H2B2	425 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	CACNG2	Q9Y698	323 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031		V9GYQ6	96 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	ISPD	A4D126	451 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	PTP4A3	O75365	173 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	DIRAS1	O95057	198 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	MPZL1	O95297	269 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	CTLA4	P16410	223 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	TUBG1	P23258	451 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	TNFSF4	P23510	183 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	OMP	P47874	163 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	LIMS1	P48059	325 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	CENPA	P49450	140 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	RPS6KA3	P51812	740 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	AQP6	Q13520	282 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	MTX3	Q5HYI7	312 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	ADCK1	Q86TW2	530 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	OR52J3	Q8NH60	311 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	COG8	Q96MW5	612 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	GAL3ST1	Q99999	423 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	MSL2	Q9HCI7	577 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRT8-208	ENST00000547031	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		13.87	□□□□□ -0.19

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