RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542838.5

DDX11-223, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DDX11, Length 3,079 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-223	ENST00000542838	FBRS	Q9HAH7	460 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	LRP4	O75096	1905 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838		A0A0G2JNG1	304 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	PRSS37	A4D1T9	235 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	AKT2	P31751	481 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	CD96	P40200	585 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	HHEX	Q03014	270 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	KIR2DS5	Q14953	304 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	CDNF	Q49AH0	187 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	ADO	Q96SZ5	270 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	ADAM19	Q9H013	955 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	PIGM	Q9H3S5	423 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	BLACE	A4D250	179 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	SLC25A12	O75746	678 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	YPEL5	P62699	121 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	CXADR	P78310	365 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	ACKR1	Q16570	336 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	LYG2	Q86SG7	212 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	ACBD4	Q8NC06	268 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	RELT	Q969Z4	430 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	C8orf44	Q96CB5	159 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	GAREM1	Q9H706	876 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	LRP12	Q9Y561	859 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	USP34	Q70CQ2	3546 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	OR5K4	A6NMS3	321 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	HCRTR2	O43614	444 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	NUDT14	O95848	222 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	ZNF117	Q03924	483 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	SQSTM1	Q13501	440 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	C1orf61	Q13536	156 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	ELOC	Q15369	112 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	VWA2	Q5GFL6	755 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	CORO6	Q6QEF8	472 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	THAP6	Q8TBB0	222 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	ABHD6	Q9BV23	337 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	LAT2	Q9GZY6	243 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	S1PR5	Q9H228	398 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	OR2AT4	A6NND4	320 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	C17orf51	A8MQB3	221 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	ATG12	O94817	140 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	FST	P19883	344 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	ZBTB25	P24278	435 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	CASR	P41180	1078 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	PRKX	P51817	358 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	HSD17B7	P56937	341 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	ROM1	Q03395	351 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	PPP1R1A	Q13522	171 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	MEF2D	Q14814	521 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	CST11	Q9H112	138 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	MEGF11	A6BM72	1044 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	SULT2B1	O00204	365 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	SIGLEC6	O43699	453 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	ICOSLG	O75144	302 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	FREM3	P0C091	2139 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	CTLA4	P16410	223 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	BDKRB2	P30411	391 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	AVPR2	P30518	371 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	CCDC157	Q569K6	752 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDX11-223	ENST00000542838	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55

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