RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 LINC00470Q9BZP3 86 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SLC19A3Q9BZV2 496 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF442Q9H7R0 627 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 IL36RNQ9UBH0 155 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 POU2F3Q9UKI9 436 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 EMCNQ9ULC0 261 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SESN1Q9Y6P5 492 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 DSCAMO60469 2012 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ARID1AO14497 2285 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CCT8L1PA6NM43 557 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 C5orf58C9J3I9 102 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 H3BSA7 217 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 AIM2O14862 343 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 TYROBPO43914 113 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CRLF1O75462 422 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SLC22A3O75751 556 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 UGT2B17O75795 530 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 LRATO95237 230 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 AHSA1O95433 338 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 C6orf47O95873 294 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 MT-ATP6P00846 226 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 FAM157CP0CG43 387 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 NR2F1P10589 423 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ACP2P11117 423 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SFTPDP35247 375 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ARR3P36575 388 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SLC1A6P48664 564 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 STARP49675 285 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ATP4BP51164 291 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 EFNA4P52798 201 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CDH11P55287 796 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 FOXA1P55317 472 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CLDN20P56880 219 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 HBA1P69905 142 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 H3F3AP84243 136 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 VLDLRP98155 873 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 RUNX1T1Q06455 604 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 EPS8Q12929 822 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 VEZF1Q14119 521 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ADIPOQQ15848 244 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CLEC12BQ2HXU8 276 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 GPAT3Q53EU6 434 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 PDZK1Q5T2W1 519 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 LIPNQ5VXI9 398 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 METTL21CQ5VZV1 264 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CLEC6AQ6EIG7 209 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM225Q6GV28 225 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 C6orf89Q6UWU4 347 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 C4orf33Q8N1A6 199 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 UBE2J2Q8N2K1 259 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 MUC15Q8N387 334 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF114Q8NC26 417 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 NUP37Q8NFH4 326 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 MFSD8Q8NHS3 518 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 PIK3R3Q92569 461 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CDS1Q92903 461 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 S100PBPQ96BU1 408 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 OR52E6Q96RD3 313 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 KCNA7Q96RP8 456 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SLC35A5Q9BS91 424 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SLC25A33Q9BSK2 321 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 PCGF1Q9BSM1 259 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 INPP5KQ9BT40 448 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 RAB1BQ9H0U4 201 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 LRMDAQ9H2I8 198 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 BCL2L10Q9HD36 194 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 C1RLQ9NZP8 487 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 RPS6KA6Q9UK32 745 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 DSPPQ9NZW4 1301 aa3.64□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 AKAP9Q99996 3911 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 MPDZO75970 2070 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 A0A0J9YW62 118 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1W2PPM1 405 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SMIM23A6NLE4 172 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 A8MV72 311 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms