RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	PMS2P3	Q13401	168 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	RPEL1	Q2QD12	228 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SKA3	Q8IX90	412 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	PRELID2	Q8N945	189 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702		Q8NBF4	154 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	NUBPL	Q8TB37	319 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	MED8	Q96G25	268 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	LITAF	Q99732	161 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	RARRES2	Q99969	163 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	MED10	Q9BTT4	135 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	MCUB	Q9NWR8	336 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TREM2	Q9NZC2	230 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ARMCX1	Q9P291	453 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	KIF25	Q9UIL4	384 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	RLF	Q13129	1914 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CEP350	Q5VT06	3117 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ATRN	O75882	1429 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1W2PRF3	423 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1W2PRM7	423 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	PSMB11	A5LHX3	300 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	MGAT4D	A6NG13	374 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC22A20	A6NK97	555 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	LYRM9	A8MSI8	78 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702		E7EWF7	191 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702		F6UB75	175 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	MGRN1	O60291	552 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CIAO1	O76071	339 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ZFAND5	O76080	213 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	HBE1	P02100	147 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	RPN2	P04844	631 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	LAMP1	P11279	417 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SYT1	P21579	422 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	HTR2C	P28335	458 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	IL2RG	P31785	369 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	UGT1A3	P35503	534 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CSK	P41240	450 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TFPI2	P48307	235 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CSNK1A1	P48729	337 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB7A	P51149	207 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	UCN	P55089	124 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ERVK11-1	P61568	191 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	LMO4	P61968	165 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ACVR1	Q04771	509 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	LEMD1	Q68G75	181 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ART5	Q96L15	291 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	LY9	Q9HBG7	655 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	STMN3	Q9NZ72	180 aa		3.14	□□□□□ -1.91

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