RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 NKAPLQ5M9Q1 402 aa9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 NXPE4Q6UWF7 544 aa9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 DHRS11Q6UWP2 260 aa9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 CLEC9AQ6UXN8 241 aa9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF620Q6ZNG0 422 aa9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 TEX19Q8NA77 164 aa9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 OR2T33Q8NG76 320 aa9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 ATG101Q9BSB4 218 aa9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 ICKQ9UPZ9 632 aa9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 URB1O60287 2271 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 CEP250Q9BV73 2442 aa9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 UGDHO60701 494 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 CD8AP01732 235 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 PNLIPP16233 465 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 NME2P22392 152 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 PAX6P26367 422 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 CERS1P27544 350 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 CD1CP29017 333 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFAF6Q330K2 333 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 SFTPA2Q8IWL1 248 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF740Q8NDX6 193 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 OR6N1Q8NGY5 312 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 POM121Q96HA1 1249 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM100Q9NV29 134 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 TRPC4Q9UBN4 977 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 ATG4BQ9Y4P1 393 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 RRP8O43159 456 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 ERI3O43414 337 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 B3GALT2O43825 422 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 OR10H2O60403 315 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 TNFSF15O95150 251 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 CD74P04233 296 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 OR4E1P0C645 316 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 FAM157CP0CG43 387 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 CD80P33681 288 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 LSM6P62312 80 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 GLB1L2Q8IW92 636 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 CYB561A3Q8NBI2 242 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 SDR9C7Q8NEX9 313 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 OR2L3Q8NG85 312 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM255BQ8WV15 326 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 CHST5Q9GZS9 411 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF318Q5VUA4 2279 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 A0A0B4J2A0 478 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 RTCAO00442 366 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 CHRM4P08173 479 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 SRMP19623 302 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 MNDAP41218 407 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 HSD17B7P56937 341 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 TRAM1Q15629 374 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 LIPNQ5VXI9 398 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 KMT5CQ86Y97 462 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 OR1J2Q8NGS2 313 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 ULBP3Q9BZM4 244 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 SHPKQ9UHJ6 478 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 SEC16AO15027 2179 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 A0A0G2JN53 185 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 FEZF1A0PJY2 475 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 THY1P04216 161 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 CD3DP04234 171 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 PGAM2P15259 253 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 ITPKBP27987 946 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 AQP2P41181 271 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 FXYD6P3P58550 94 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 PDZD11Q5EBL8 140 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 C1orf189Q5VU69 101 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00471Q8N535 108 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 DCBLD2Q96PD2 775 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 MESP1Q9BRJ9 268 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 PELI2Q9HAT8 420 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 NRIP3Q9NQ35 241 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 CACFD1Q9UGQ2 172 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 PCNX2A6NKB5 2137 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 VCANP13611 3396 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 ARID1AO14497 2285 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 H7C1Q1 480 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 PEX12O00623 359 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 SCRG1O75711 98 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 PSMB10P40306 273 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 GABREP78334 506 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM244Q5VVB8 128 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 TMPRSS12Q86WS5 348 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-211ENST00000520276 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.11□□□□□ -0.95
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