RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513284.5

RNF4-218, Transcript of ring finger protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene RNF4, Length 517 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF4-218ENST00000513284 ZNF229Q9UJW7 825 aa9.3□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 NDUFAF1Q9Y375 327 aa9.3□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 SACSQ9NZJ4 4579 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 TRAPPC13A5PLN9 417 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 GMNCA6NCL1 334 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 CENPBD1B2RD01 187 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 M0QX08 132 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 GPR37O15354 613 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 TSPAN9O75954 239 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 SFTPBP07988 381 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 QDPRP09417 244 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 CD247P20963 164 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 STOMP27105 288 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 APLNRP35414 380 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 LIPAP38571 399 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 IER3P46695 156 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 CLRN1P58418 232 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 NPTX1Q15818 432 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 ZNF74Q16587 644 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 ENTPD8Q5MY95 495 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 ZNF841Q6ZN19 808 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 SLC16A14Q7RTX9 510 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 DHDDSQ86SQ9 333 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 MSRB3Q8IXL7 192 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 LRRC18Q8N456 261 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 ITPKCQ96DU7 683 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 EBF4Q9BQW3 602 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 WFDC6Q9BQY6 131 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 RASSF4Q9H2L5 321 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 NANOGQ9H9S0 305 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 NECAP2Q9NVZ3 263 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 TAS2R5Q9NYW4 299 aa9.29□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 A0A1W2PRG6 482 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 M0R3H8 397 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 TPST2O60704 377 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 CH25HO95992 272 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 PGA4P0DJD7 388 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 PGA3P0DJD8 388 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 MMP9P14780 707 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 FUT4P22083 530 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 IFNA8P32881 189 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 DAP3P51398 398 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 PPP1CBP62140 327 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 GNB2P62879 340 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 HSF2Q03933 536 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 EGR3Q06889 387 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 HIST3H3Q16695 136 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 RUNDC3AQ59EK9 446 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 MTX3Q5HYI7 312 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 GPR157Q5UAW9 335 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 SLC27A4Q6P1M0 643 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 LYPD2Q6UXB3 125 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 LINC00114Q6XXX2 140 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 OR6T1Q8NGN1 323 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 TBC1D15Q8TC07 691 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 TSPEARQ8WU66 669 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 ITLN1Q8WWA0 313 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 STON2Q8WXE9 905 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 MCHR2Q969V1 340 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 PPP1R14AQ96A00 147 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 TBX15Q96SF7 602 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 SH3GL1Q99961 368 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 TMEM246Q9BRR3 403 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 POFUT1Q9H488 388 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 GCM1Q9NP62 436 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 MRGBPQ9NV56 204 aa9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
RNF4-218ENST00000513284 C5orf49A4QMS7 147 aa9.27□□□□□ -0.93
RNF4-218ENST00000513284 C22orf46C9J442 243 aa9.27□□□□□ -0.93
RNF4-218ENST00000513284 ICMTO60725 284 aa9.27□□□□□ -0.93
RNF4-218ENST00000513284 OPN1SWP03999 348 aa9.27□□□□□ -0.93
RNF4-218ENST00000513284 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
RNF4-218ENST00000513284 CPT2P23786 658 aa9.27□□□□□ -0.93
RNF4-218ENST00000513284 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
RNF4-218ENST00000513284 PSG4Q00888 419 aa9.27□□□□□ -0.93
RNF4-218ENST00000513284 NFYCQ13952 458 aa9.27□□□□□ -0.93
RNF4-218ENST00000513284 MELKQ14680 651 aa9.27□□□□□ -0.93
RNF4-218ENST00000513284 DUSP7Q16829 419 aa9.27□□□□□ -0.93
RNF4-218ENST00000513284 FAM201AQ5SY85 155 aa9.27□□□□□ -0.93
RNF4-218ENST00000513284 HDXQ7Z353 690 aa9.27□□□□□ -0.93
RNF4-218ENST00000513284 C10orf111Q8N326 155 aa9.27□□□□□ -0.93
RNF4-218ENST00000513284 DPP10Q8N608 796 aa9.27□□□□□ -0.93
RNF4-218ENST00000513284 NOXO1Q8NFA2 376 aa9.27□□□□□ -0.93
RNF4-218ENST00000513284 OR2Z1Q8NG97 314 aa9.27□□□□□ -0.93
RNF4-218ENST00000513284 AKR7LQ8NHP1 331 aa9.27□□□□□ -0.93
RNF4-218ENST00000513284 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
RNF4-218ENST00000513284 FNDC8Q8TC99 324 aa9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms