RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 FGFBP3Q8TAT2 258 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 SLC25A40Q8TBP6 338 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM165Q9HC07 324 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 THAP1Q9NVV9 213 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ADPRHL2Q9NX46 363 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 LRP12Q9Y561 859 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CEACAM18A8MTB9 384 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 M0R1W7 72 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 SEC14L2O76054 403 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 TXNDC12O95881 172 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 QDPRP09417 244 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 GKN3PP0CG01 181 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 BGNP21810 368 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 HSF2Q03933 536 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 BNIP2Q12982 314 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ECH1Q13011 328 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OR13G1Q8NGZ3 307 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 LINC01006Q8NI28 216 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 DNAJA3Q96EY1 480 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 MS4A3Q96HJ5 214 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 INIPQ9NRY2 104 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 RNF114Q9Y508 228 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ZANQ9Y493 2812 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 MSR1P21757 451 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CDH12P55289 794 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CLRN1P58418 232 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 NCALDP61601 193 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 UFM1P61960 85 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ERVK-25P63136 954 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 PSG4Q00888 419 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 AQP6Q13520 282 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF781Q8N8C0 355 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 TXNDC15Q96J42 360 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 PKP2Q99959 881 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 GCM1Q9NP62 436 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 SLC17A7Q9P2U7 560 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CLIC1O00299 241 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 GPR137BO60478 399 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 GMDSO60547 372 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OR6A2O95222 327 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 SHBGP04278 402 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CSF1P09603 554 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ETFAP13804 333 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 MAKP20794 623 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 MPV17P39210 176 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CDK6Q00534 326 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 GUCY1A3Q02108 690 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 MELKQ14680 651 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CHI3L2Q15782 390 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 TTMPQ5BVD1 217 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 GPR157Q5UAW9 335 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 SIKE1Q9BRV8 207 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 RNF121Q9H920 327 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 C5orf58C9J3I9 102 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 MT-ND1P03886 318 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 HIST1H2ABP04908 130 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 LCKP06239 509 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 LCN2P80188 198 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ATRQ13535 2644 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 AVPI1Q5T686 147 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 MIER2Q8N344 545 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OR11L1Q8NGX0 322 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 HIST1H2ACQ93077 130 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 MOGAT1Q96PD6 335 aa6.41□□□□□ -1.38
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