RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 FZR1Q9UM11 496 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 BAIAP2Q9UQB8 552 aa18■□□□□ 0.47
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ACTB-211ENST00000480301 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 SGCEO43556 437 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 TFP02787 698 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 LCKP06239 509 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 ADRA2AP08913 450 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 COX5BP10606 129 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 PRKACGP22612 351 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 CCNIQ14094 377 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 SLC36A3Q495N2 470 aa17.99■□□□□ 0.47
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ACTB-211ENST00000480301 C1orf146Q5VVC0 180 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 ZNF525Q8N782 197 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 CYB561A3Q8NBI2 242 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 SLC37A3Q8NCC5 494 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 SLC26A10Q8NG04 563 aa17.99■□□□□ 0.47
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ACTB-211ENST00000480301 OR10H5Q8NGA6 315 aa17.99■□□□□ 0.47
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ACTB-211ENST00000480301 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 CCDC121Q6ZUS5 278 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 HIST2H3AQ71DI3 136 aa17.98■□□□□ 0.47
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ACTB-211ENST00000480301 ZNRF4Q8WWF5 429 aa17.98■□□□□ 0.47
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ACTB-211ENST00000480301 RAB1BQ9H0U4 201 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 DYNLRB1Q9NP97 96 aa17.98■□□□□ 0.47
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ACTB-211ENST00000480301 LHFPL6Q9Y693 200 aa17.98■□□□□ 0.47
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ACTB-211ENST00000480301 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa17.97■□□□□ 0.47
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ACTB-211ENST00000480301 ALDH3B1P43353 468 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 DSCR9P59020 149 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 TEKQ02763 1124 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 CLEC2AQ6UVW9 174 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 OR1J1Q8NGS3 322 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 SYNPRQ8TBG9 265 aa17.97■□□□□ 0.47
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ACTB-211ENST00000480301 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
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ACTB-211ENST00000480301 ANXA8P13928 327 aa17.96■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 PYCR1P32322 319 aa17.96■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 HTR5AP47898 357 aa17.96■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 CRMP1Q14194 572 aa17.96■□□□□ 0.47
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ACTB-211ENST00000480301 CORO6Q6QEF8 472 aa17.96■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa17.96■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 IQCF1Q8N6M8 205 aa17.96■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 ICA1LQ8NDH6 482 aa17.96■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 OR2T4Q8NH00 348 aa17.96■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 TEX47Q8TBZ9 253 aa17.96■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 C4orf45Q96LM5 186 aa17.96■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa17.96■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
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ACTB-211ENST00000480301 H3BN98 237 aa17.95■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 OSMP13725 252 aa17.95■□□□□ 0.46
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ACTB-211ENST00000480301 ARHGDIAP52565 204 aa17.95■□□□□ 0.46
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ACTB-211ENST00000480301 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa17.95■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 GJC3Q8NFK1 279 aa17.95■□□□□ 0.46
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ACTB-211ENST00000480301 OR1F12Q8NHA8 337 aa17.95■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 ABHD4Q8TB40 342 aa17.95■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A40Q8TBP6 338 aa17.95■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 C10orf105Q8TEF2 133 aa17.95■□□□□ 0.46
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ACTB-211ENST00000480301 SLC7A6Q92536 515 aa17.95■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 FAM168AQ92567 244 aa17.95■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 MS4A5Q9H3V2 200 aa17.95■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 CMC2Q9NRP2 79 aa17.95■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 TAAR3PQ9P1P4 343 aa17.95■□□□□ 0.46
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