RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470953.1

VARS-222, Transcript of valyl-tRNA synthetase, human

TSL 3

Gene VARS, Length 392 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VARS-222	ENST00000470953	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953		A0A1W2PPL8	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953		A0A1W2PPW3	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MS4A18	H0YCH9	400 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ZNF432	O94892	652 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	GPANK1	O95872	356 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NGF	P01138	241 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	HLA-H	P01893	362 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ADRA2A	P08913	450 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	FUT1	P19526	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	AQP2	P41181	271 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	RANBP1	P43487	201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	GPR4	P46093	362 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	GIPR	P48546	466 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CRYBA2	P53672	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CTAG1A	P78358	180 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SPIB	Q01892	262 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NAAA	Q02083	359 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PLP2	Q04941	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PIGF	Q07326	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	DAG1	Q14118	895 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	RCN1	Q15293	331 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SLC36A2	Q495M3	483 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CBLL1	Q75N03	491 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	OAF	Q86UD1	273 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NRM	Q8IXM6	262 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TEX29	Q8N6K0	151 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	OR4F5	Q8NH21	305 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	OR6X1	Q8NH79	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NSMAF	Q92636	917 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	LRR1	Q96L50	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CDH20	Q9HBT6	801 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	AURKC	Q9UQB9	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953		A6NIZ1	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953		H0YL77	283 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953		J3KTA2	159 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953		J3QLI3	93 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	FZD7	O75084	574 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	THY1	P04216	161 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CELA3B	P08861	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	QDPR	P09417	244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CBR1	P16152	277 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ACADS	P16219	412 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NPR2	P20594	1047 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CALCR	P30988	508 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	S100A5	P33763	92 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	THBS4	P35443	961 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SLC9A3	P48764	834 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SMIM11A	P58511	58 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SELENOV	P59797	346 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	RAP1B	P61224	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	RAP1A	P62834	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	HGFAC	Q04756	655 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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