RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 CBR3O75828 277 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 RPP14O95059 124 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 OR6A2O95222 327 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 MT-CO3P00414 261 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 IGLV3-1P01715 115 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 SPARCP09486 303 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 ICAM2P13598 275 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 TCN2P20062 427 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 ACHEP22303 614 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 CCL1P22362 96 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 ANOS1P23352 680 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 AHCYP23526 432 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 LAP3P28838 519 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 PITPNBP48739 271 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 BIDP55957 195 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRC-210ENST00000462363 RPS15P62841 145 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC35A1P78382 337 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
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PTPRC-210ENST00000462363 ACER2Q5QJU3 275 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 SLC22A10Q63ZE4 541 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRC-210ENST00000462363 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
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PTPRC-210ENST00000462363 FAM220AQ7Z4H9 259 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 DTX1Q86Y01 620 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 CMTM4Q8IZR5 234 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 ESX1Q8N693 406 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 OR4K17Q8NGC6 315 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 OR6F1Q8NGZ6 308 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 GPR148Q8TDV2 347 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRC-210ENST00000462363 SMIM4Q8WVI0 70 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRC-210ENST00000462363 ST6GAL2Q96JF0 529 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 FOXN4Q96NZ1 517 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 OR5B2Q96R09 309 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRC-210ENST00000462363 RABL2BQ9UNT1 228 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC22A13Q9Y226 551 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRC-210ENST00000462363 LYRM1O43325 122 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 SULT1B1O43704 296 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRC-210ENST00000462363 ITGA5P08648 1049 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 RFPL3SP0C7P2 107 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 HLA-DMAP28067 261 aa5□□□□□ -1.61
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