RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460258.5

NOP56-204, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 4

Gene NOP56, Length 837 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-204ENST00000460258 TRIM31Q9BZY9 425 aa10.01□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 KCNK9Q9NPC2 374 aa10.01□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 PRDM4Q9UKN5 801 aa10.01□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa10□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 NKX6-3A6NJ46 265 aa10□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 F5H5P2 479 aa10□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 GSTA2P09210 222 aa10□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 PAICSP22234 425 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 RPL38P63173 70 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 C9orf66Q5T8R8 295 aa10□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 NCR3LG1Q68D85 454 aa10□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 C10orf99Q6UWK7 81 aa10□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 FGFRL1Q8N441 504 aa10□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 NPEPL1Q8NDH3 523 aa10□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 OR11L1Q8NGX0 322 aa10□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 MIPOL1Q8TD10 442 aa10□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 SLC38A4Q969I6 547 aa10□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 HAVCR1Q96D42 359 aa10□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 SLC41A3Q96GZ6 507 aa10□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 PBKQ96KB5 322 aa10□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 KCNN2Q9H2S1 579 aa10□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 WDR91A4D1P6 747 aa9.99□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 CDHR4A6H8M9 788 aa9.99□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 LGALS8O00214 317 aa9.99□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 G6PDP11413 515 aa9.99□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 PRG2P13727 222 aa9.99□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 IMPDH1P20839 514 aa9.99□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 MYCNOSP40205 109 aa9.99□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 PSG4Q00888 419 aa9.99□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 GUCY1A3Q02108 690 aa9.99□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 PUDPQ08623 228 aa9.99□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa9.99□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 PXKQ7Z7A4 578 aa9.99□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 OR13G1Q8NGZ3 307 aa9.99□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 Q8TCH9 128 aa9.99□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 ZNF566Q969W8 418 aa9.99□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 ITCHQ96J02 903 aa9.99□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 P2RX4Q99571 388 aa9.99□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 TCF19Q9Y242 345 aa9.99□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa9.98□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 LDLRAD4O15165 306 aa9.98□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 MLNRO43193 412 aa9.98□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 NDUFA2O43678 99 aa9.98□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 FAM20BO75063 409 aa9.98□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 ABHD16AO95870 558 aa9.98□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 GYPAP02724 150 aa9.98□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 RPL3P39023 403 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 RAB25P57735 213 aa9.98□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 OR8B8Q15620 311 aa9.98□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 PLA1AQ53H76 456 aa9.98□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 COLCA1Q6ZS62 124 aa9.98□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 C8orf86Q6ZUL3 223 aa9.98□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 OR6X1Q8NH79 312 aa9.98□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 DMRTB1Q96MA1 342 aa9.98□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 SLC38A1Q9H2H9 487 aa9.98□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 LZTFL1Q9NQ48 299 aa9.98□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 ATAD3AQ9NVI7 634 aa9.98□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 KLHL14Q9P2G3 628 aa9.98□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 SCOCQ9UIL1 159 aa9.98□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 A6NDX4 124 aa9.97□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 SLC28A1O00337 649 aa9.97□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 DBIP07108 87 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 TAC1P20366 129 aa9.97□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 TUBG1P23258 451 aa9.97□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 RAB13P51153 203 aa9.97□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 ZNF84P51523 738 aa9.97□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 ERVK-25P63136 954 aa9.97□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 NFYCQ13952 458 aa9.97□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 SYPL1Q16563 259 aa9.97□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 C5orf46Q6UWT4 87 aa9.97□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa9.97□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 NATD1Q8N6N6 113 aa9.97□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 ANKFN1Q8N957 763 aa9.97□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 OR8G5Q8NG78 346 aa9.97□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 OR52H1Q8NGJ2 320 aa9.97□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 OR2T11Q8NH01 316 aa9.97□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 SPATA9Q9BWV2 254 aa9.97□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 ASPNQ9BXN1 380 aa9.97□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa9.97□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 TUBG2Q9NRH3 451 aa9.97□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 CAPN7Q9Y6W3 813 aa9.97□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
NOP56-204ENST00000460258 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa9.96□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa9.96□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 MAGEA12P43365 314 aa9.96□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 HCP5Q6MZN7 132 aa9.96□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 ZNF836Q6ZNA1 936 aa9.96□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 C18orf65Q6ZTR6 163 aa9.96□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 NUDCD3Q8IVD9 361 aa9.96□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa9.96□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 C10orf111Q8N326 155 aa9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms