RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC35A1P78382 337 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCARB2Q14108 478 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 SQLEQ14534 574 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 P2RY6Q15077 328 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 RGNQ15493 299 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF311Q5JNZ3 666 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 NCMAPQ5T1S8 102 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSPO2Q5TGU0 170 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf140Q5VVS0 124 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 CARD17Q5XLA6 110 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 WBP2NLQ6ICG8 309 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 NIPAL3Q6P499 406 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q6ZTK2 550 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 FUNDC1Q8IVP5 155 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 KDM8Q8N371 416 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM99Q8N816 258 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMYD1Q8NB12 490 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 BBS10Q8TAM1 723 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIGTQ969N2 578 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 RADILQ96JH8 1075 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM204Q9BSN7 226 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAPBPLQ9BX59 468 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 CACNG6Q9BXT2 260 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 A4GALTQ9NPC4 353 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYSLTR2Q9NS75 346 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAS2R16Q9NYV7 291 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 CALML5Q9NZT1 146 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM181Q9P2C4 612 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 MALT1Q9UDY8 824 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa3.84□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANK2Q01484 3957 aa3.84□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1B0GWA3 101 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 DPRXA6NFQ7 191 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF724A8MTY0 619 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SHISA9B4DS77 424 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF587BE7ETH6 402 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRN3E7EW58 273 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 C11orf98E9PRG8 122 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANGPT2O15123 496 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SSX4O60224 188 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 TPST1O60507 370 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 TIPRLO75663 272 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SOX30O94993 753 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 PGM3O95394 542 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV4-39P01824 125 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 LCATP04180 440 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPIP06744 558 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 HOXB5P09067 269 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 TFPTP0C1Z6 253 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZCCHC18P0CG32 403 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 PNMTP11086 282 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAPZA2P47755 286 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC18A1P54219 525 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLDN17P56750 224 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARF1P84077 181 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDK6Q00534 326 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPRL3Q12980 569 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 FADDQ13158 208 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 HNF4GQ14541 408 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 MELKQ14680 651 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC17A1Q14916 467 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CARTPTQ16568 116 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLEC12BQ2HXU8 276 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 PGGHGQ32M88 737 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 TIMM23BQ5SRD1 257 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SHEQ5VZ18 495 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBXW9Q5XUX1 488 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 REP15Q6BDI9 236 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAQR6Q6TCH4 344 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINGO2Q7L985 606 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 AAED1Q7RTV5 226 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 BIVMQ86UB2 503 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF440Q8IYI8 595 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 C10orf53Q8N6V4 93 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF525Q8N782 197 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF611Q8N823 705 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 MUCL1Q96DR8 90 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 WFDC6Q9BQY6 131 aa3.83□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms