RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 EPHA1P21709 976 aa17.78■□□□□ 0.44
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LIMS1-208ENST00000428064 SLC7A2P52569 658 aa17.78■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 HILS1P60008 231 aa17.78■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 MESTQ5EB52 335 aa17.78■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 MTX3Q5HYI7 312 aa17.78■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 CYP4Z1Q86W10 505 aa17.78■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF570Q96NI8 536 aa17.78■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa17.78■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 PRSS37A4D1T9 235 aa17.77■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 H7C1C5 153 aa17.77■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 XKRYO14609 159 aa17.77■□□□□ 0.44
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LIMS1-208ENST00000428064 Q96M85 177 aa17.77■□□□□ 0.44
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LIMS1-208ENST00000428064 ABCD2Q9UBJ2 740 aa17.77■□□□□ 0.44
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LIMS1-208ENST00000428064 LOC105371242A0A075B767 164 aa17.76■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa17.76■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PRQ8 180 aa17.76■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 PPIAL4DF5H284 164 aa17.76■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 J3QW42 95 aa17.76■□□□□ 0.43
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LIMS1-208ENST00000428064 AQP6Q13520 282 aa17.76■□□□□ 0.43
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LIMS1-208ENST00000428064 DCAF12L2Q5VW00 463 aa17.76■□□□□ 0.43
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LIMS1-208ENST00000428064 MSL2Q9HCI7 577 aa17.76■□□□□ 0.43
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LIMS1-208ENST00000428064 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
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LIMS1-208ENST00000428064 ZNF446Q9NWS9 450 aa17.75■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
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LIMS1-208ENST00000428064 SIGLEC7Q9Y286 467 aa17.75■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 NPTNQ9Y639 398 aa17.75■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 PTP4A3O75365 173 aa17.74■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 FSHBP01225 129 aa17.74■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV2-70P01814 119 aa17.74■□□□□ 0.43
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LIMS1-208ENST00000428064 TNFSF4P23510 183 aa17.74■□□□□ 0.43
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LIMS1-208ENST00000428064 FAM162AQ96A26 154 aa17.74■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 SAMD8Q96LT4 415 aa17.74■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa17.73■□□□□ 0.43
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LIMS1-208ENST00000428064 OR6C6A6NF89 314 aa17.73■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 FOXH1O75593 365 aa17.73■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 H1F0P07305 194 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 RHCEP18577 417 aa17.73■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 NUDT2P50583 147 aa17.73■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 SPRNQ5BIV9 151 aa17.73■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 TREML1Q86YW5 311 aa17.73■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 GLB1L2Q8IW92 636 aa17.73■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 ST7LQ8TDW4 575 aa17.73■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
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