RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R1AQ13522 171 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MEP1BQ16820 701 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CLRN3Q8NCR9 226 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR1J2Q8NGS2 313 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF417Q8TAU3 575 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PHF21AQ96BD5 680 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR92Q96MX6 357 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FERD3LQ96RJ6 166 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MNTQ99583 582 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ULBP3Q9BZM4 244 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LPAR5Q9H1C0 372 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OSGIN2Q9Y236 505 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ESPL1Q14674 2120 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 DMXL1Q9Y485 3027 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PQD3 144 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 IFITM10A6NMD0 228 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MS4A18H0YCH9 400 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ATG12O94817 140 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 F13BP05160 661 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CSF1P09603 554 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GRPRP30550 384 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FNTBP49356 437 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PITPNAQ00169 270 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MS4A18Q3C1V0 323 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM69Q5SWH9 247 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FRMD1Q8N878 549 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MFFQ9GZY8 342 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 C5orf66Q9H5L9 145 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GLS2Q9UI32 602 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PRELID1Q9Y255 219 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 AMDHD2Q9Y303 409 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0B4J2A0 478 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMD9O00233 223 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RAD51DO75771 328 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PAX1P15863 534 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 IL32P24001 234 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 BDKRB2P30411 391 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CAPZBP47756 277 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TPMTP51580 245 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 STX4Q12846 297 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PHF19Q5T6S3 580 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LPCAT3Q6P1A2 487 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CHMP1BQ7LBR1 199 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 HOGA1Q86XE5 327 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CSNK1A1LQ8N752 337 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 HPSE2Q8WWQ2 592 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 COL26A1Q96A83 441 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC22A18Q96BI1 424 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ARL6Q9H0F7 186 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TAS2R10Q9NYW0 307 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SHPKQ9UHJ6 478 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM212A6NML5 194 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 I3L1I5 382 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 L7N2F9 121 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PHOX2AO14813 284 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 WISP2O76076 250 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CTSSP25774 331 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CAPZA1P52907 286 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PRPS1P60891 318 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR119Q8TDV5 335 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GNG8Q9UK08 70 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TPRP12270 2363 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PMS2P2O95744 297 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ECDO95905 644 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV2-5P01817 119 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GABRG2P18507 467 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 STEAP1BQ6NZ63 245 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 BTNL8Q6UX41 500 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SZRD1Q7Z422 152 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 HDDC2Q7Z4H3 204 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR10A5Q9H207 317 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF222Q9UK12 451 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MKL2Q9ULH7 1088 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RWDD3Q9Y3V2 267 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FIGNL2A6NMB9 653 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZZEF1O43149 2961 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 BCL2L11O43521 198 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CD63P08962 238 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ACHEP22303 614 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CASRP41180 1078 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 NPBWR1P48145 328 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa3.22□□□□□ -1.89
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