RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416108.5

RBM39-208, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 4

Gene RBM39, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-208	ENST00000416108	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108		J3QRE1	110 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	SGCE	O43556	437 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	DOK2	O60496	412 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ZNF254	O75437	659 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	WNT11	O96014	354 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	CGA	P01215	116 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	APOC1	P02654	83 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	PRB1	P04280	392 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	HTR1A	P08908	422 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	LIMS3	P0CW19	117 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	LIMS4	P0CW20	117 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	HSMCR30	P0CW71	290 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ZNF32	P17041	273 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ALOX5AP	P20292	161 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	COX5A	P20674	150 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	PAX7	P23759	505 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ARR3	P36575	388 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ETV1	P50549	477 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ASCL1	P50553	236 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	NR1H2	P55055	460 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	TAS2R43	P59537	309 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	IRF3	Q14653	427 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	RAB35	Q15286	201 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	SPHAR	Q15513	63 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	IGFBP7	Q16270	282 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	PCK2	Q16822	640 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	CDON	Q4KMG0	1287 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	TP53I3	Q53FA7	332 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	CORO6	Q6QEF8	472 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	SPATC1	Q76KD6	591 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ZNF627	Q7L945	461 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	SKA3	Q8IX90	412 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	SYS1	Q8N2H4	156 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ZNF843	Q8N446	348 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	C4orf36	Q96KX1	117 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	OR8B4	Q96RC9	309 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	NIPAL2	Q9H841	368 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108		A8MXE2	369 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	PSMD9	O00233	223 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	LRRTM2	O43300	516 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	SULT1C4	O75897	302 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	PTH	P01270	115 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	SCG5	P05408	212 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	LCK	P06239	509 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	CD79B	P40259	229 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	HTR5A	P47898	357 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	UQCRFS1	P47985	274 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ECH1	Q13011	328 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	GABRA6	Q16445	453 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	TIGD6	Q17RP2	521 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	GSG1	Q2KHT4	349 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	SSX6	Q7RTT6	188 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	GPR141	Q7Z602	305 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	KLB	Q86Z14	1044 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		7.36	□□□□□ -1.23

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