RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384143.1

RNU6-398P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 398, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-398P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-398P-201ENST00000384143 LIPAP38571 399 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 CDKN2CP42773 168 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 ERFP50548 548 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 EFNB2P52799 333 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 KRTAP10-11P60412 298 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 HSF2Q03933 536 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 COX10Q12887 443 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 CASP8Q14790 479 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF404Q494X3 552 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC36A2Q495M3 483 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 NRN1LQ496H8 165 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZMAT1Q5H9K5 638 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 DEFB121Q5J5C9 76 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 SPANXN4Q5MJ08 99 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 LRRC34Q8IZ02 419 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 Q8N1Y9 231 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 LRRC18Q8N456 261 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 KLHDC1Q8N7A1 406 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 SCAIQ8N9R8 606 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 CCDC63Q8NA47 563 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 VPS37AQ8NEZ2 397 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 OR8B3Q8NGG8 313 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 PPP1R35Q8TAP8 253 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 LHX4Q969G2 390 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 PLEKHA8Q96JA3 519 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 TEX37Q96LM6 180 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 WDFY2Q96P53 400 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 OR2V2Q96R30 315 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 OR8B2Q96RD0 313 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 B9D2Q9BPU9 175 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 RHOXF2Q9BQY4 288 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 SPATA9Q9BWV2 254 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC19A3Q9BZV2 496 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 SIRPDQ9H106 197 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 DPAGT1Q9H3H5 408 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 CTSZQ9UBR2 303 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 CLN8Q9UBY8 286 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 MIOXQ9UGB7 285 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 TBK1Q9UHD2 729 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 DCDC2Q9UHG0 476 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 USH1CQ9Y6N9 552 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 CCDC154A6NI56 674 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 C3orf84H3BNL1 204 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 H3BSA7 217 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 PHYHO14832 338 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 FCN3O75636 299 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLPIP03973 132 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 ABHD2P08910 425 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 PGA4P0DJD7 388 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 PGA3P0DJD8 388 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 ADORA3P0DMS8 318 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 CD28P10747 220 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 ETFAP13804 333 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF32P17041 273 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 TNFSF4P23510 183 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 CPT2P23786 658 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 EPHA3P29320 983 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 CDAP32320 146 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 TGFBR2P37173 567 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 PMELP40967 661 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 GDI2P50395 445 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 MVDP53602 400 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 EMX2Q04743 252 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 CCDC153Q494R4 210 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 ALG10BQ5I7T1 473 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 ANXA8L1Q5VT79 327 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 PGBD2Q6P3X8 592 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 C5orf46Q6UWT4 87 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 CD300LDQ6UXZ3 194 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC35D2Q76EJ3 337 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 PXKQ7Z7A4 578 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 DPPA2Q7Z7J5 298 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 GALNT4Q8N4A0 578 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 SCCPDHQ8NBX0 429 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 HIPK4Q8NE63 616 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 C19orf18Q8NEA5 215 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 OR4S1Q8NGB4 309 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 OR10AD1Q8NGE0 317 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 OR6S1Q8NH40 331 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 OR6X1Q8NH79 312 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC38A5Q8WUX1 472 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 LRTOMTQ8WZ04 291 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 MCHR2Q969V1 340 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF566Q969W8 418 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 NABP1Q96AH0 204 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 TUBGCP3Q96CW5 907 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 R3HDM4Q96D70 268 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 TMEM19Q96HH6 336 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 PPP1R36Q96LQ0 422 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-398P-201ENST00000384143 CCDC115Q96NT0 180 aa3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms