RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 CRCT1Q9UGL9 99 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-38P-201ENST00000384085 PEX16Q9Y5Y5 336 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-38P-201ENST00000384085 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-38P-201ENST00000384085 CNTNAP1P78357 1384 aa1.21□□□□□ -2.21
RNU6-38P-201ENST00000384085 DOCK8Q8NF50 2099 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A1B0GW55 424 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 SNTNA6NMZ2 147 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 J3QRE1 110 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLIC3O95833 236 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSPAN12O95859 305 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 CD3GP09693 182 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 DUX4L2P0CJ85 424 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 DUX4L3P0CJ86 424 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 DUX4L5P0CJ88 424 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 DUX4L6P0CJ89 424 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 DUX4L7P0CJ90 424 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 HCAR3P49019 387 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDKN2DP55273 166 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 PDK3Q15120 406 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATAD3BQ5T9A4 648 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 PDIK1LQ8N165 341 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR1L6Q8NGR2 347 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 PIBF1Q8WXW3 757 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 C12orf42Q96LP6 360 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 RSG1Q9BU20 258 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 CWH43Q9H720 699 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 C8orf17Q9NRJ1 99 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 DUX4Q9UBX2 424 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 ING4Q9UNL4 249 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 SCN1AP35498 2009 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 BTBD17A6NE02 478 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM47DPA6NHR8 397 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 L7N2F9 121 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 GMFGO60234 142 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 RDH16O75452 317 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 NDUFB10O96000 172 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 ETS2P15036 469 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF250P15622 560 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAB3AP20336 220 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 P2RX1P51575 399 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDK5Q00535 292 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF235Q14590 738 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 TCEAL5Q5H9L2 206 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 AVPI1Q5T686 147 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM222AQ5U5X8 452 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 PMF1Q6P1K2 205 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 SDR9C7Q8NEX9 313 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 TCEAL3Q969E4 200 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 GALNT14Q96FL9 552 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 IP6K3Q96PC2 410 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBBP8Q99708 897 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 RHOXF2Q9BQY4 288 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 TM2D3Q9BRN9 247 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC39A3Q9BRY0 314 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERP44Q9BS26 406 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 EDA2RQ9HAV5 297 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 NT5MQ9NPB1 228 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 C21orf62Q9NYP8 219 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 NPTNQ9Y639 398 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 SDK2Q58EX2 2172 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A1W2PPV9 198 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 MANBAO00462 879 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 EEDO75530 441 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC22A5O76082 557 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM50AO95807 157 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGLV3-25P01717 112 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 SSR4P51571 173 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 RND2P52198 227 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 KCNJ2P63252 427 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 TGFBIQ15582 683 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 ADNP2Q6IQ32 1131 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 HCP5Q6MZN7 132 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM136Q6ZRR5 245 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZFP41Q8N8Y5 198 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 FBXL13Q8NEE6 735 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR1S2Q8NGQ3 325 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRRC29Q8WV35 223 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 WDR34Q96EX3 536 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 PKNOX2Q96KN3 472 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms