RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 LRRTM1Q86UE6 522 aa10.13□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC16A11Q8NCK7 471 aa10.13□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 RAB40AQ8WXH6 277 aa10.13□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 PMM1Q92871 262 aa10.13□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 FOXN4Q96NZ1 517 aa10.13□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF251Q9BRH9 671 aa10.13□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 DEFB126Q9BYW3 111 aa10.13□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 NRSN2Q9GZP1 204 aa10.13□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 APMAPQ9HDC9 416 aa10.13□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 PISDQ9UG56 409 aa10.13□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 MIOXQ9UGB7 285 aa10.13□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 FBXO4Q9UKT5 387 aa10.13□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF337Q9Y3M9 751 aa10.13□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa10.13□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 THADAQ6YHU6 1953 aa10.13□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 LOC100509620A0A075B734 347 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A0A6YYD5 115 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 H3BML4 177 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 KCNAB3O43448 404 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 MAOAP21397 527 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 LSSP48449 732 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 PLGLB1Q02325 96 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 PLA2G7Q13093 441 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF595Q8IYB9 648 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 CDS1Q92903 461 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 GPER1Q99527 375 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 PTDSS2Q9BVG9 487 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 TINAGQ9UJW2 476 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 PKDREJQ9NTG1 2253 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A087WV48 116 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 FGF17O60258 216 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 TBX19O60806 448 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 CD3DP04234 171 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 ACTA2P62736 377 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 ACTG2P63267 376 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 LTBQ06643 244 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 OR7A5Q15622 319 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM220AQ7Z4H9 259 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 CDRT4Q8N9R6 151 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 OR52R1Q8NGF1 315 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM131CQ96AQ9 280 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 LYRM4Q9HD34 91 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 SCN2AQ99250 2005 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 TRAV18A0A075B6X5 111 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 TRAPPC13A5PLN9 417 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 C2orf72A6NCS6 295 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 BCL2L11O43521 198 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 ACTL6AO96019 429 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 IFNGP01579 166 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 PRKAR1BP31321 381 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 EIPR1Q53HC9 387 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 CARD17Q5XLA6 110 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 GLT8D1Q68CQ7 371 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF836Q6ZNA1 936 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 UBE3DQ7Z6J8 389 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC35F2Q8IXU6 374 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 LPAR4Q99677 370 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 EDEM2Q9BV94 578 aa10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 A6NCN8 305 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 PEX12O00623 359 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 OGG1O15527 345 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC6A9P48067 706 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 EMP2P54851 167 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 SRYQ05066 204 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 SPEM2Q0P670 501 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 UQCC3Q6UW78 93 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 ARMC10Q8N2F6 343 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM105Q8N8V8 129 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 ADOQ96SZ5 270 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 ULBP3Q9BZM4 244 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 PILRBQ9UKJ0 227 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 NSA2O95478 260 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 SMIM6P0DI80 62 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 SFTPDP35247 375 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 ZIC1Q15915 447 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 VWA2Q5GFL6 755 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 C5orf46Q6UWT4 87 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 OR6N1Q8NGY5 312 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 NT5CQ8TCD5 201 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 MIB2Q96AX9 1013 aa10.11□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms