RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368460.7

PBXIP1-201, Transcript of PBX homeobox interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene PBXIP1, Length 1,175 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBXIP1-201ENST00000368460 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa15.49■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 ATG16L2Q8NAA4 619 aa15.49■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 MOSPD2Q8NHP6 518 aa15.49■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 WFDC12Q8WWY7 111 aa15.49■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 UPRTQ96BW1 309 aa15.49■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 MAGEB18Q96M61 343 aa15.49■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 ALG12Q9BV10 488 aa15.49■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 TXNIPQ9H3M7 391 aa15.49■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 IFNL4K9M1U5 179 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 TIMM23O14925 209 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 ICMTO60725 284 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 MSR1P21757 451 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 TUBG1P23258 451 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 HTR5AP47898 357 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 ALG10Q5BKT4 473 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 TTMPQ5BVD1 217 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 NLRC3Q7RTR2 1065 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 TMEM255BQ8WV15 326 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 TMEM239Q8WW34 195 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 RAB40AQ8WXH6 277 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 CMBLQ96DG6 245 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 PRSS27Q9BQR3 290 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 SLC30A2Q9BRI3 323 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 CCDC28BQ9BUN5 200 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 PCDHAC1Q9H158 963 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 MMP27Q9H306 513 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 TUBG2Q9NRH3 451 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 TBCCD1Q9NVR7 557 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 MIOXQ9UGB7 285 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 SH3GLB1Q9Y371 365 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 MED31Q9Y3C7 131 aa15.48■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 NPIPB13A6NJU9 1138 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 NPIPB4C9JG80 1138 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 TMEM178BH3BS89 294 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 ANGPT2O15123 496 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 PLATP00750 562 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 WNT2P09544 360 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 CPT2P23786 658 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 IDH3AP50213 366 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 LAPTM4AQ15012 233 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 DEFB112Q30KQ8 113 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 GPR157Q5UAW9 335 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 OLFML2AQ68BL7 652 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 C1orf94Q6P1W5 598 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 DLEU7Q6UYE1 221 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 BRD3OSQ6XYD6 125 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 KLBQ86Z14 1044 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 NKAIN4Q8IVV8 208 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 OR8B3Q8NGG8 313 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 OR10S1Q8NGN2 331 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 TAMM41Q96BW9 452 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 COG8Q96MW5 612 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 OR8B2Q96RD0 313 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 SIGLEC11Q96RL6 698 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 PKP2Q99959 881 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 PARD6BQ9BYG5 372 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 C20orf141Q9NUB4 165 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 KIF17Q9P2E2 1029 aa15.47■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 NOTCH1P46531 2555 aa15.46■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 SRRM5B3KS81 715 aa15.46■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 DOK2O60496 412 aa15.46■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 ZNF205O95201 554 aa15.46■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 KITLGP21583 273 aa15.46■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 MMP16P51512 607 aa15.46■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 SLC18A1P54219 525 aa15.46■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 RPL27P61353 136 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 GUCY1A3Q02108 690 aa15.46■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 SCRN3Q0VDG4 424 aa15.46■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 FAM205BPQ63HN1 556 aa15.46■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 SLC27A4Q6P1M0 643 aa15.46■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 Q6ZR03 302 aa15.46■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 OR5AS1Q8N127 324 aa15.46■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 CGREF1Q99674 301 aa15.46■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 EBF4Q9BQW3 602 aa15.46■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 RABEP2Q9H5N1 569 aa15.46■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 MARCH7Q9H992 704 aa15.46■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 NDUFAF1Q9Y375 327 aa15.46■□□□□ 0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 LRRC30A6NM36 301 aa15.45■□□□□ 0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 OR5F1O95221 314 aa15.45■□□□□ 0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 CTXN1P60606 82 aa15.45■□□□□ 0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 NFYCQ13952 458 aa15.45■□□□□ 0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 SELPLGQ14242 412 aa15.45■□□□□ 0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 SYT9Q86SS6 491 aa15.45■□□□□ 0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 CLDN22Q8N7P3 220 aa15.45■□□□□ 0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 C7orf26Q96N11 449 aa15.45■□□□□ 0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 POFUT1Q9H488 388 aa15.45■□□□□ 0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 GCM1Q9NP62 436 aa15.45■□□□□ 0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 RIMS3Q9UJD0 308 aa15.45■□□□□ 0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 BAG5Q9UL15 447 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms