RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 PLEKHA1Q9HB21 404 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 SPHK2Q9NRA0 654 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 MPP6Q9NZW5 540 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 MGMTP16455 207 aa3.04□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 NPBWR1P48145 328 aa3.04□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 CCR9P51686 369 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 SMSP52788 366 aa3.04□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 TMEM270Q6UE05 265 aa3.04□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 DPPA4Q7L190 304 aa3.04□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 C17orf47Q8NEP4 570 aa3.04□□□□□ -1.92
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