RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF160Q9HCG1 818 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 MIOXQ9UGB7 285 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 NLRC5Q86WI3 1866 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 PTGESO14684 152 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 PGA4P0DJD7 388 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 PGA5P0DJD9 388 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 EPXP11678 715 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 FOLR1P15328 257 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 DIO3P55073 304 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 FXYD6P3P58550 94 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 KRTDAPP60985 99 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CRTC1Q6UUV9 634 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 NHLRC1Q6VVB1 395 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 IL22RA1Q8N6P7 574 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CENPMQ9NSP4 180 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ALKBH4Q9NXW9 302 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CD84Q9UIB8 345 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 FAM24AA6NFZ4 105 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 SPINT2O43291 252 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 SCO2O43819 266 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CSO75390 466 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 TBX18O95935 607 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CFDP00746 253 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CSF2P04141 144 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 LAMP1P11279 417 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 SGSHP51688 502 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CDKN2DP55273 166 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CLDN6P56747 220 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 GRB7Q14451 532 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 DBX2Q6ZNG2 339 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 LSMEM1Q8N8F7 131 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 POGLUT1Q8NBL1 392 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 MSLNLQ96KJ4 702 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 SLC17A9Q9BYT1 436 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 KCNK12Q9HB15 430 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 OR52A1Q9UKL2 312 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 DSCR3O14972 297 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 FABP7O15540 132 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ZFAND5O76080 213 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 RPS25P62851 125 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 EML3Q32P44 896 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF573Q86YE8 665 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CPOQ8IVL8 374 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 NPEPL1Q8NDH3 523 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 OR4D10Q8NGI6 311 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 OR4K13Q8NH42 304 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 GRHL3Q8TE85 626 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 FAM3DQ96BQ1 224 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 LPAR4Q99677 370 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
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PTPRD-201ENST00000355233 NDUFB6O95139 128 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 GABRR1P24046 479 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 THBS4P35443 961 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 SLC6A11P48066 632 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 FHITP49789 147 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 PMCHL1Q16048 86 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM240Q5SV17 173 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 Q6ZRG5 221 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CALHM3Q86XJ0 350 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 LINC00346Q8IVM7 164 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CADM3Q8N126 398 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 OR13C4Q8NGS5 318 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CASTOR1Q8WTX7 329 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 RASL12Q9NYN1 266 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 EHFQ9NZC4 300 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 MGAMO43451 1857 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ARGFXA6NJG6 315 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 DCTDP32321 178 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 PREPP48147 710 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 MEOX2P50222 304 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CAV2P51636 162 aa4.51□□□□□ -1.69
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PTPRD-201ENST00000355233 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 Q7L0L9 218 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 SPPL3Q8TCT6 385 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ZNRF4Q8WWF5 429 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ELSPBP1Q96BH3 223 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 C7orf34Q96L11 122 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 GAL3ST4Q96RP7 486 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 C12orf57Q99622 126 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 VAMP8Q9BV40 100 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 POFUT1Q9H488 388 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 PARP11Q9NR21 331 aa4.51□□□□□ -1.69
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