RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 PGA3P0DJD8 388 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 TYRP1P17643 537 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 DMWDQ09019 674 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 NOGQ13253 232 aa5.07□□□□□ -1.6
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PTPRB-202ENST00000334414 FZD6O60353 706 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 HERVK_113P61574 105 aa5.07□□□□□ -1.6
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PTPRB-202ENST00000334414 AQP6Q13520 282 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 MBTPS1Q14703 1052 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 PKDCCQ504Y2 493 aa5.07□□□□□ -1.6
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PTPRB-202ENST00000334414 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 VIPR2P41587 438 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 PPOXP50336 477 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 Q8IYB0 196 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 SLC38A9Q8NBW4 561 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 LHX4Q969G2 390 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 CXorf65A6NEN9 183 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 PLSCR1O15162 318 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 NRASP01111 189 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 HRASP01112 189 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 KRASP01116 189 aa5.06□□□□□ -1.6
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