RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 A0A0B4J2A0 478 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 SERINC4A6NH21 518 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 C1orf196B1AJZ1 125 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 FAM157AC9JC47 383 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 MAOAP21397 527 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 AVPR2P30518 371 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 TAS2R31P59538 309 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 KCNAB1Q14722 419 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 CDNFQ49AH0 187 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 MESTQ5EB52 335 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 GLYATL3Q5SZD4 288 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 TMEM244Q5VVB8 128 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 CORO6Q6QEF8 472 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 ZNF600Q6ZNG1 722 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 ZNF679Q8IYX0 411 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 ZFP82Q8N141 532 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 ZNF561Q8N587 486 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 PLPP7Q8NBV4 271 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 ASB5Q8WWX0 329 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 SUSD6Q92537 303 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 AQP10Q96PS8 301 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 OR5B2Q96R09 309 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 TAAR9Q96RI9 348 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 LMF1Q96S06 567 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 NUDT9Q9BW91 350 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 GRHPRQ9UBQ7 328 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 SHPKQ9UHJ6 478 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 DHDHQ9UQ10 334 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 TMED7Q9Y3B3 224 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 TRAV20A0A0B4J274 112 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 CEACAM18A8MTB9 384 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 STK17BO94768 372 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 RENP00797 406 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 CSTAP01040 98 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 IGHV2-70P01814 119 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 MT-ND4LP03901 98 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 CD2P06729 351 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 FCGR3AP08637 254 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 FBXO45P0C2W1 286 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 ZNF44P15621 663 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 CENPAP49450 140 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 ADPRHP54922 357 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 STARD6P59095 220 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 GPR18Q14330 331 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 OR7A5Q15622 319 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 HMGN3Q15651 99 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 ZNF260Q3ZCT1 412 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 WBP2NLQ6ICG8 309 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 C5orf46Q6UWT4 87 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 TAF8Q7Z7C8 310 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 OR4N2Q8NGD1 307 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 ING5Q8WYH8 240 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 DCUN1D4Q92564 292 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 TSPAN32Q96QS1 320 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 AMELYQ99218 206 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 ELOVL3Q9HB03 270 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 SLC22A11Q9NSA0 550 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 ZNF860A6NHJ4 632 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 ICOSLGO75144 302 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 IGHV2-5P01817 119 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 INHAP05111 366 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 SFTA3P0C7M3 94 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 ZNF806P0C7X5 589 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 SP3Q02447 781 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 HGFACQ04756 655 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 ENPP2Q13822 863 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 SMCO1Q147U7 214 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 PRSS54Q6PEW0 395 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 RHOUQ7L0Q8 258 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 SLC16A13Q7RTY0 426 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 CA13Q8N1Q1 262 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 DTWD2Q8NBA8 298 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 HIST1H2BAQ96A08 127 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 MOGAT1Q96PD6 335 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 LPAR4Q99677 370 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
GINS3-202ENST00000328514 DNAJB11Q9UBS4 358 aa10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms