RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 IDH3BO43837 385 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 DOK2O60496 412 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 RENP00797 406 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 DAOP14920 347 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRABP1P29762 137 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 LSM6P62312 80 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 FLOT2Q14254 428 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNMB1Q16558 191 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 MICAQ29983 383 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNM1P34Q6PK57 102 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR6V1Q8N148 313 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR52L1Q8NGH7 329 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYNPRQ8TBG9 265 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 CANT1Q8WVQ1 401 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHID1Q9BWS9 393 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 MS4A5Q9H3V2 200 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 FN3KQ9H479 309 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL20Q9NYY1 176 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 B9D1Q9UPM9 204 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR6C68A6NDL8 312 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 INAFM1C9JVW0 142 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 COX5BP10606 129 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAT2P11245 290 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOS3P29474 1203 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 NR4A2P43354 598 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 HTR5AP47898 357 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 BNIP1Q12981 228 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 MEP1BQ16820 701 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 NKPD1Q17RQ9 610 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM249Q2WGJ8 235 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALKBH6Q3KRA9 238 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM255AQ5JRV8 349 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPATA46Q5T0L3 261 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 DGCR6LQ9BY27 220 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAAR3PQ9P1P4 343 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCA2Q9BZC7 2435 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD5LO43866 347 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 CST1P01037 141 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 NGFP01138 241 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 TP53P04637 393 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 USF1P22415 310 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 MPV17P39210 176 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 CENPAP49450 140 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLO1Q04760 184 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 GK3PQ14409 553 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBTB46Q86UZ6 589 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF786Q8N393 782 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPEPL1Q8NDH3 523 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC26A10Q8NG04 563 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10G2Q8NGC3 310 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR52E2Q8NGJ4 325 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABHD4Q8TB40 342 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A40Q8TBP6 338 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 C4orf45Q96LM5 186 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 BPESC1Q9GZL8 116 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D23Q9NUY8 699 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 POMPQ9Y244 141 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLR1DQ9Y2S0 133 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 LHFPL6Q9Y693 200 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR6C6A6NF89 314 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCR1O76036 304 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOX14O95416 240 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV3-13P01766 116 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 HPXP02790 462 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSTM3P21266 225 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 GIFP27352 417 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 SELENOVP59797 346 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP1CBP62140 327 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST1H3AP68431 136 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 GGTLC2Q14390 218 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST2H3AQ71DI3 136 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPATA24Q86W54 205 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4Q3Q8NH05 313 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBASH3BQ8TF42 649 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDOQ99489 341 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2J1Q9GZK6 312 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLEK2Q9NYT0 353 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARRDC5A6NEK1 342 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 LYNX1G3V0Z9 82 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 RER1O15258 196 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSC2O15499 205 aa16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms